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hjsjs

铜虫 (正式写手)

[交流] 【求助】求助关于ion-molecule complex 的离子与分子的距离问题

最近在研究sn2反应,有个地方一直困惑不解,比如F- +CH3Cl -----Cl- +CH3F

当F离子和分子CH3Cl形成ion-molecule 混合物的时候,F离子到碳原子之间的距离是如何设置的,看到gaussian自带的练习的输入文件这个距离设置是2.585,同理当Cl原子与CH3F形成混合物的时候,距离是3.422,这两个值是查找资料得到的还是自己随意设置的

ion-molecule 混合物的离子和分子之间并没有成键,是通过范德华力的吸引,而文献中的这个距离大致是成键后键长的两倍略小点,ion-molecule 混合物是反应中形成的中间体,在势能面上位于能量最低点,到底应该怎样寻找这个精确值,因为离子和分子间距离小一点或者大一点,就都不是这个最低点了。看有文献中提到 这个点叫critical points,翻译为临界点,现在的问题是如何确定临界点

优化是必须的,但是在确定准确距离后进行的,因为优化的进行只改变角度,而并不能改变距离

[ Last edited by hjsjs on 2009-7-29 at 17:54 ]
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yytsnake

至尊木虫 (职业作家)


erylingjet(金币+1,VIP+0):感谢交流工 7-29 15:15
不是随意的,应该是比其真实键长略长一些,介与断与不断之间。
2楼2009-07-29 10:03:39
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recoli

金虫 (正式写手)


erylingjet(金币+1,VIP+0):感谢交流 7-29 15:15
优化。反应物复合物以及产物复合物都可以优化。
3楼2009-07-29 13:13:03
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hjsjs

铜虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★
yuhuobuku(金币+4,VIP+0):欢迎参加讨论 7-30 21:04
不是这样的
ion-molecule 混合物的离子和分子之间并没有成键,是通过范德华力的吸引,而文献中的这个距离大致是成键后键长的两倍略小点,ion-molecule 混合物是反应中形成的中间体,在势能面上位于能量最低点,到底应该怎样寻找这个精确值,因为离子和分子间距离小一点或者大一点,就都不是这个最低点了。看有文献中提到 这个点叫critical points,翻译为临界点,现在的问题是如何确定临界点

优化是必须的,但是在确定准确距离后进行的,因为优化的进行只改变角度,而并不能改变距离

[ Last edited by hjsjs on 2009-7-29 at 17:52 ]
4楼2009-07-29 14:53:07
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recoli

金虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★ ★
hjsjs(金币+2,VIP+0): 7-29 20:03
yuhuobuku(金币+3,VIP+0):欢迎参加讨论 7-30 21:05
把F阴离子放在CH3Cl的中轴线上,F和Cl在C的两侧,优化就是了,得到的结果就是复合物啊。当然F不能离C太近,受到三个H的空间排斥力,看着差不多,作为初始结构去优化,没有问题啊。
5楼2009-07-29 19:07:29
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