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严恪yanke

新虫 (著名写手)

[求助] 求助哪位前辈能给一个查询微生物代谢问题的建议吗?

我甚至不敢确定自己选择的主题是否合适,自己真是太菜了emmm。
就是我通过高通量测序,发现在我的实验体系中有一种菌所占比例持续增大,在一个物种信息查询的网站上(LPSN)查到的相关文献只有一篇,提到的这种微生物代谢途径是通过氧化二价铁获得能量,但这种环境条件和实际不太相符。
之后我就迷茫了,想查查是不是有其它代谢途径,但是完全不知道从哪开始。我都不知道我的疑惑有没有描述清楚,我是学环境的,虽然我们平时会涉及到一点浅薄的微生物知识,但这个方向深入了再自己找资料学习感觉毫无方向,不知道从哪开始。
我也知道一点NCBI,但是查到一段核酸序列好像对我的帮助不大。EDGG里面的代谢通路,但我不知道这种菌可能存在什么代谢途径,已知的代谢途径不太符合实际条件。不过说到底,还是因为我对这些了解的太浅,感觉自己没辙了emmmm

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匿名

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3楼2021-02-25 23:54:59
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zg1415

金虫 (正式写手)

分离出来看看呗,
一直被模仿,从未被超越
2楼2021-01-17 08:52:30
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