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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 能量与原子位移的关系可以用phonopy直接得到吗
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Sahira

新虫 (小有名气)

[求助] 能量与原子位移的关系可以用phonopy直接得到吗

请问这两张图是要手动移动原子位置，计算能量，还是直接用phonopy可以得出原子位移与能量的关系？
算出声子谱有虚频，想按照图中移动原子位置试试看。

图上传不了，大家想象一下吧，横轴是一个原子的位移，从-0.02到0.02，纵轴是能量，位移为0的位置是个鞍点，0.07和-0.07的位置是最小值，整体就像一个“W”一样，“W”的中间极大值点和两边的极小值点能量差为1meV。
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1楼 2021-01-10 22:22:06
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卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur
光看一组原子移动是没办法确定是不是因为这个原子没有优化正确而引起虚频的，实际某个振动模式往往是多个原子贡献的，只有一些特别简单的体系看某个原子的移动才有用。
如果你了解原理的话，一般声子谱计算其实需要算各种原子移动构成的Hessian矩阵再进行对角化，之后得到的本征矢往往不是只有某一个原子的贡献。
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不一定挂在论坛，计算问题问题欢迎留言。
2楼2021-01-12 01:35:08
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Sahira

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 卡开发发 at 2021-01-12 01:35:08
光看一组原子移动是没办法确定是不是因为这个原子没有优化正确而引起虚频的，实际某个振动模式往往是多个原子贡献的，只有一些特别简单的体系看某个原子的移动才有用。
如果你了解原理的话，一般声子谱计算其实需要 ...

愿来如此，看来我看的文献计算的应该是简单体系，可以通过移动原子位置确定，我的体系原子比较多，我通过查看震动模式移动原子消掉了虚频，但我还有一个问题，就是我的原胞有9个原子，通过计算phonon dos看到虚频主要是其中一个原子贡献的，我通过移动这个原子看能量是否会降低，但其实并没有，原始的位置能量是最低的，这样我知道了虚频是哪个原子贡献的有什么意义呢，可以做什么事情？
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3楼2021-01-12 21:36:42
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