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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 分类/鉴定 » 诚心请教：两株菌的16S测序结果很相似，可以算是同一株菌吗？谢谢！
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zengjiarui

新虫 (初入文坛)

[求助] 诚心请教：两株菌的16S测序结果很相似，可以算是同一株菌吗？谢谢！ 已有4人参与

分离了一些肠球菌，27F和1492R引物对扩增测序后，发现它们的序列信息很相似，很多只在序列的首尾部分有一些不同碱基，请教一下它们会是同一株菌吗？非常感谢！
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1楼 2021-01-08 11:23:34
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zengjiarui

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by pansyg12 at 2021-01-08 16:47:36
不是可以把序列拿去NCBI里比对

已经在NCBI里比对过了，大概可以确认种属，只是不知道我得到的那几株菌，会不会其实是同一株？
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4楼2021-01-08 20:26:26
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pansyg12

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

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不是可以把序列拿去NCBI里比对
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2楼2021-01-08 16:47:36
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嘟嘟熊levi

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
看你的实验目的，单单只是做一个鉴定，NCBI中去比对就好了，看得分和相似性。如果要是论文中的一部分数据，还要建树，还有其他的形态和生理生化鉴定。
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我凝望天涯，寻觅我的诗句
3楼2021-01-08 20:19:36
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zengjiarui

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 嘟嘟熊levi at 2021-01-08 20:19:36
看你的实验目的，单单只是做一个鉴定，NCBI中去比对就好了，看得分和相似性。如果要是论文中的一部分数据，还要建树，还有其他的形态和生理生化鉴定。

其实主要问题不是鉴定种属，而是想确认一下，分离得到的那几株菌，会不会其实是同一株？毕竟它们的16S序列很相似
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5楼2021-01-08 20:27:58
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