24小时热门版块排行榜    

查看: 499  |  回复: 8
当前主题已经存档。

jxzxm98

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助】求助!!!关于Gaussian

知道木虫的高手多,特此向虫友们请教;今天看了篇相关的文献,里面有这么段话:We used chem3D (CambridgeSoft) to create the input files of Gaussian. For binary mixture, we constructed two molecules of binary mixture in chem3D together and constructed the input file of Gaussian using chem3D.
理解不了,是否Gaussian软件具有某些功能,可以模拟拼接之类的;要不二元复合体系的相关参数怎么得到的呢?
PS:我做的是QSAR,然后查到相关文献有此疑问;
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

greatqi

木虫 (正式写手)

★ ★ ★
jxzxm98(金币+1,VIP+0):2 7-28 18:35
yuhuobuku(金币+2):欢迎参加讨论
Chem3D和Chemdraw是共显示联用的。如果你想拼接两个分子可以直接在Chemdraw画出来,然后自然就可以看到拼接的两个分子。拼接后可以直接输出the input files of Gaussian。
2楼2009-07-28 08:18:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jxzxm98

金虫 (正式写手)

请问在chemdraw里面如何拼接两分子?,如果可以拼接的话,是否左右、上下等空间差异会导致相关参数的不同,如果是的话,那这篇文献有是如何确定的呢?
3楼2009-07-28 08:47:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zyy816

至尊木虫 (著名写手)

★ ★ ★ ★ ★
jxzxm98(金币+2,VIP+0): 7-28 18:35
yuhuobuku(金币+3):欢迎参加讨论
所谓对接,应该是调整两个分子在空间合适位置吧
估计作者是根据经验或者其它有机知识,在chem3d里面调整好两个分子的相对空间位置,然后用gs的输入文件方式输出,如果这样的话,其实用gview更加好用
4楼2009-07-28 15:12:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jxzxm98

金虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by zyy816 at 2009-7-28 15:12:
所谓对接,应该是调整两个分子在空间合适位置吧
估计作者是根据经验或者其它有机知识,在chem3d里面调整好两个分子的相对空间位置,然后用gs的输入文件方式输出,如果这样的话,其实用gview更加好用

你好,能否详细些?
5楼2009-07-28 15:26:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pdce218

金虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★
jxzxm98(金币+1,VIP+0):2 7-28 18:35
yuhuobuku(金币+3):欢迎参加讨论
基本步骤:
① 在辅助软件界面上构建分子,规整化为“标准构型”或用分子力学法进行初步几何优化
② 存为PDB 格式文件;
③ 打开Gauss的主窗口,用Utilities-NewMat 读入PDB 格式文件并转换为Z-矩阵;
④ 在跳出的作业编辑对话框上补充完成输入文件
明天会更好……
6楼2009-07-28 17:21:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

CKX

木虫 (著名写手)

请将文献上传,让大家好好分析
7楼2009-07-28 19:25:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

neweroica

木虫 (著名写手)

★ ★ ★
jxzxm98(金币+1,VIP+0): 7-29 10:43
yuhuobuku(金币+2):欢迎参加讨论
怎么感觉那个文献的作者不是专业做计算的,居然连那样的话都发表出来
Simpler, stronger, more tolerant
8楼2009-07-28 22:55:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jxzxm98

金虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by neweroica at 2009-7-28 22:55:
怎么感觉那个文献的作者不是专业做计算的,居然连那样的话都发表出来

我看文献的时候也有这样的感觉,但是自己又不懂Gaussian,特来此请教啊。
9楼2009-07-29 09:23:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 jxzxm98 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 CyTWnZiM0cS6 2026-08-02 5/250 2026-08-02 20:43 by 3VGOm6paSgqv
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 AS6fX1tr1on4 2026-08-02 5/250 2026-08-02 20:31 by 3VGOm6paSgqv
[找工作] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 AS6fX1tr1on4 2026-08-02 5/250 2026-08-02 20:31 by 3VGOm6paSgqv
[公派出国] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 AS6fX1tr1on4 2026-08-02 7/350 2026-08-02 20:24 by 3VGOm6paSgqv
[基金申请] 这种情况还有戏吗 +5 drbart 2026-07-27 12/600 2026-08-02 20:21 by drbart
[硕博家园] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 AS6fX1tr1on4 2026-08-02 9/450 2026-08-02 20:18 by 3VGOm6paSgqv
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 AS6fX1tr1on4 2026-08-02 10/500 2026-08-02 20:12 by 3VGOm6paSgqv
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 AS6fX1tr1on4 2026-08-02 14/700 2026-08-02 20:11 by 3VGOm6paSgqv
[基金申请] 面上提前没消息,有中的吗 +11 archvillain 2026-08-02 13/650 2026-08-02 20:09 by symmetry
[找工作] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 cBGhfJFuNMca 2026-08-02 13/650 2026-08-02 20:04 by 3VGOm6paSgqv
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +5 cBGhfJFuNMca 2026-08-02 17/850 2026-08-02 20:03 by 3VGOm6paSgqv
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 cBGhfJFuNMca 2026-08-02 10/500 2026-08-02 20:03 by 3VGOm6paSgqv
[考博] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 cBGhfJFuNMca 2026-08-02 21/1050 2026-08-02 19:52 by 3VGOm6paSgqv
[博后之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 AS6fX1tr1on4 2026-08-02 8/400 2026-08-02 18:44 by ca3DVAx4OB19
[考研] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 AS6fX1tr1on4 2026-08-02 9/450 2026-08-02 18:27 by ca3DVAx4OB19
[博后之家] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 AS6fX1tr1on4 2026-08-02 8/400 2026-08-02 18:24 by ca3DVAx4OB19
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 cBGhfJFuNMca 2026-08-02 15/750 2026-08-02 16:23 by jHcrHMhbKCFV
[基金申请] 面上再次挂了,太难了,躺也躺不了,倦也卷不过,小学校之殇! +18 低垂的野花 2026-07-31 24/1200 2026-08-02 16:03 by swallowwh
[基金申请] 2026年国自然面上资助率 +15 布布和一二 2026-07-30 21/1050 2026-08-02 10:56 by iaeyuan
[有机交流] 产物和副产物价值比较 30+4 小汤02 2026-07-27 5/250 2026-07-30 12:44 by czyzsu
信息提示
请填处理意见