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水天一色元

新虫 (正式写手)

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[求助] 在做转录组基因差异表达分析的时候，发现下调基因远多于上调基因能说明什么问题呢？已有1人参与

如题

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1楼 2020-12-16 16:17:37

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fuyuandj86

版主 (著名写手)

己所不欲，勿施于人

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【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1

RNA-seq有时候也是有bias的。比如不同样本间转录本的长度，片段的大小都会影响检测的倾向性。
如果一个组用的是降解严重的RNA样品和另一个组用的样品没什么降解，就可能出现这种现象。
确保自己的实验有足够的重复数，做RNA-seq前务必测量一下RIN值，RIN值太低就不要报以侥幸心理还继续做RNA-seq

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The doer of good becomes good, the doer of evil becomes evil.

2楼2020-12-18 11:42:41

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