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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 综合其他 » 有人用sparcc做过microbiome network analysis吗
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lijsirene

银虫 (正式写手)
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有人用sparcc做过microbiome network analysis吗
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如题，

手上有细菌16S rRNA的扩增子测序数据。打算看看OTU之间的相关性如何

(主要有三个感兴趣的OTU，想了解它们对宿主上的其他菌十分有促进或抑制作用，所以想从正负相关上推断下)。

翻看网页似乎用得比较多的是sparcc
想请教有相关经验的大神具体代码和参数，可私信我！

谢谢

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1楼 2020-12-16 14:35:46
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秋土豆香2楼
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wxiaona3楼
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tzynew4楼
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游子奔波5楼
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szgllp04086楼
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fgmsyutong7楼
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QC88楼
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Andy三木五岳9楼
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GongQQ202010楼
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mango&12楼
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sdhzbj13楼
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douziying14楼
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zjj8815楼
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AnikiDP20楼
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黄坤梅21楼
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萤火虫之谷22楼
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