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怎么在一段UTR序列中 分辨出来哪段是SD序列
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xuweitao
铁杆木虫 (著名写手)
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一下纯粹摘抄： Shine-Dalgarno （SD）是细菌和古细菌中信使RNA中核糖体结合位点序列。通常位于翻译起始密码子AUG上游约8~10个碱基位置。一般来说，mRNA与核糖体的结合程度越强，翻译的起始效率就越大，而这种结合程度主要取决于SD序列与16S rRNA的碱基互补性，其中以GGAG 4个碱基序列尤为重要。其中，大肠杆菌的SD序列为AGGAGGU。对多数基因而言，这4个碱基中任何一个换成C或T，均会导致翻译效率大幅度降低。 换句话说，只有细菌或古菌的基因5‘UTR有对应的SD序列，一般是在ATG密码子的上游6-10个碱基位置，核心序列是GGAG，因不同基因或物种可能有变化。 |
2楼2020-12-15 08:41:41