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怎么在一段UTR序列中 分辨出来哪段是SD序列
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xuweitao
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一下纯粹摘抄: Shine-Dalgarno (SD)是细菌和古细菌中信使RNA中核糖体结合位点序列。通常位于翻译起始密码子AUG上游约8~10个碱基位置。一般来说,mRNA与核糖体的结合程度越强,翻译的起始效率就越大,而这种结合程度主要取决于SD序列与16S rRNA的碱基互补性,其中以GGAG 4个碱基序列尤为重要。其中,大肠杆菌的SD序列为AGGAGGU。对多数基因而言,这4个碱基中任何一个换成C或T,均会导致翻译效率大幅度降低。 换句话说,只有细菌或古菌的基因5‘UTR有对应的SD序列,一般是在ATG密码子的上游6-10个碱基位置,核心序列是GGAG,因不同基因或物种可能有变化。 |
2楼2020-12-15 08:41:41












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