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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 其他 » 关于基于SYBYL2.0做药物筛选的问题
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mo轩～

新虫 (初入文坛)

[交流] 关于基于SYBYL2.0做药物筛选的问题

请问构建药效团模型的时候没有用到原配体对最终筛选出来的分子的真阳性有影响吗？用SYBYL2.0做的分子对接，与在DS软件查看其2D作用图是否会一致（氢键、疏水）？经过虚拟筛选和分子对接后，靶点预测的结果不理想怎么办？是否还能继续往下做或该怎么继续做下去？谢谢解答
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1楼 2020-12-11 12:26:57
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扯不断

铜虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
药效团构建有很多方法，不一定要用原配体。但模型要能筛出原配体。有没有影响要检验过才知道。靶点预测结果不理想是指什么，没有检验的情况下，打分普遍过小可能是由于对接做得不够好，或者口袋选取不当。建议用DOCK6做筛选，百度搜索【小分子虚拟筛选（DOCK 6.9）】计算教程。
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2楼2021-11-23 18:27:34
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cngdkpmg

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 扯不断 at 2021-11-23 18:27:34
药效团构建有很多方法，不一定要用原配体。但模型要能筛出原配体。有没有影响要检验过才知道。靶点预测结果不理想是指什么，没有检验的情况下，打分普遍过小可能是由于对接做得不够好，或者口袋选取不当。建议用DOC ...

学到了，谢谢
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3楼2021-11-23 18:33:15
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