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基于MS的Forcite模块模拟氢在钨表面的物理吸附
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目的：介绍Forcite在生成分子在表面的优化结构中的使用。 模块：Forcite 背景： 在Materials Studio中Forcite是一个经典分子力学工具，由Accelrys科学家和软件工程师设计，可以执行一系列任务，包括对单分子或周期性系统的快速能量计算和几何优化。它提供了使用不同力场的方法，很适合初学者使用，它也为有经验的用户提供了广泛的自定义选项。 介绍： 详细了解表面相互作用和反应，在许多材料的设计和加工中起着关键的作用， 在这种研究中重要的第一步是分子物理吸附到表面的优化几何模型(即能量最小化)的准备。在建模方法中涉及的步骤是从纯晶体表面构造表面、分子向表面的添加、研究气－固相互作用势能的定义(即力场)、然后是几何优化计算。 本教程的目的是解释在研究气体在表面的物理吸附中涉及的不同步骤，在本教程中的系统是一个受到氢吸附到钨表面的研究的启发而产生的例子。在本例中，可以见到分子力学的使用，它可以作为更昂贵的量子力学计算方法的先驱，一旦结构已经用Forcite进行了优化，就可以使用DMol3或者CASTEP来研究化学吸附反应。 1. 从纯晶体建立金属表面 (1) 劈开W(100)表面 第一步是载入想要劈开的的晶体结构，在本例中，将使用纯钨(W)。 从菜单栏选择File | Import，定位到structures/metals/pure-metals并选择W.msi。 钨的晶体结构显示在一个叫W.xsd的3D Atomistic文件中，现在打开Cleave Surface对话框。 从菜单栏选择Build | Surfaces | Cleave Surface。 显示Cleave Surface 对话框，如图8－1所示。 在晶胞上显示蓝色的虚线，指出你正在劈开的晶面。这个信息在Surface Box选项卡顶部也给出了，默认的晶面是-1 0 0，它与(1 0 0)晶面是等价的，所以你不需要改变这一设置。 为了确保最终的模型能包含气体分子与钨原子之间的全部有意义的相互作用，需要改变晶胞的厚度。 增加Fractional Thickness 到2.0。 详细内容请见： https://www.jishulink.com/content/post/1292685 |
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厉娜
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