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cuteCarl

新虫 (初入文坛)

[求助] lammps 周期边界条件为啥会原子丢失啊

新人,金币不多,请见谅
我什么我使用了周期边界条件,还会出现院子丢失的现象啊
下面是我的in文件

echo           screen
dimension      3
boundary       p p fm
units          metal

atom_style     atomic
neighbor       2.0 bin
neigh_modify   every 1 delay 5 check yes

region         box block 0.0 100.0 0.0 25.0 0.0 200.0
create_box     2 box

region         wall_down block 0.0 100.0 0.0 25.0 0.0 10.0
region         wall_up block 0.0 100.0 0.0 25.0 190.0 200.0
region         wall_shape1 cone z 12.5 12.5 10.0 0.0  10.0 20.0
region         wall_shape2 cone z 37.5 12.5 10.0 0.0  10.0 20.0
region         wall_shape3 cone z 62.5 12.5 10.0 0.0  10.0 20.0
region         wall_shape4 cone z 87.5 12.5 10.0 0.0  10.0 20.0
region         flow block 0.0 100.0 0.0 25.0 10.0 30.0

lattice        fcc 5.738
create_atoms   1 region flow

lattice        fcc 3.483
create_atoms   1 region wall_down
create_atoms   1 region wall_up
create_atoms   1 region wall_shape1   
create_atoms   1 region wall_shape2
create_atoms   1 region wall_shape3
create_atoms   1 region wall_shape4

mass           1 39.948
mass           2 39.948

pair_style     hybrid lj/cut  8.5  dpd/tstat  10.0  98.0  8.5 34387
pair_coeff     1 1 lj/cut 0.0103125 3.4
pair_coeff     1 2 lj/cut 0.0505    3.4
pair_coeff     2 2 lj/cut 0.00515625 3.4
pair_coeff     1 1 dpd/tstat 0.0672 8.5
comm_modify    vel yes

group 1 region wall_shape1
group 2 region wall_shape2
group 3 region wall_shape3
group 4 region wall_shape4
group 5 region wall_down
group 5 region wall_up
group wall union 1 2 3 4 5 6
group flow region flow
group Ar subtract all wall
set   group wall type 2

velocity flow create 86 482748 mom yes rot yes
fix      1 all nvt temp 10.0 98.0 0.02
compute  1 Ar chunk/atom bin/2d y lower 2 z lower 2 units box

velocity wall set 0.0 0.0 0.0
fix      2 wall setforce 0.0 0.0 0.0
fix      3 flow ave/chunk 100 5 500 1 density/mass file new.profile

timestep  0.005
thermo    20
thermo_style custom step temp pe press density etotal

dump      1 all custom 20 new.dump id x y z
run       310000

各位大佬,帮忙看一下吧
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哈呵呀

新虫 (小有名气)

有可能是从Z方向跑出去了,Z方向上设置一下wall/reflect试试

发自小木虫Android客户端
2楼2020-11-27 10:23:36
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cuteCarl

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 哈呵呀 at 2020-11-27 10:23:36
有可能是从Z方向跑出去了,Z方向上设置一下wall/reflect试试

再请教一下,我加了fix 4 flow wall/reflect zhi 200.0还是不行,是不是我写错了,我看手册是这样呀新手太难了

发自小木虫Android客户端
3楼2020-11-28 09:13:53
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