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可视化的最低能量路径绘制程序MEPplot测试版本发布
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各位同仁,大家好。 最近我开发了一个能量最低路径绘制的可视化程序,它叫MEPplot。 该程序旨在解决在势能面(自由能面)上绘制最低能量路径。 绘制能量最低路径在计算化学与分子动力学模拟领域有一定的需求。截至目前(2020年11月26),我暂时没发现一个集成的软件包可以处理。 该程序基于 string method。在几年前我发布过一个指令行版本,该版本难用而且不稳健。因此将几年前的程序做可视化并且对算法稳定性进行修改。 他还在测试过程中,可能有一些bug和设计缺陷。恳请各位同行在本贴下方提出问题,或者在项目的GitHub issue区提交问题。 程序发布网页: https://github.com/chenxin199261/MEPplot |
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