| 查看: 1949 | 回复: 3 | ||
| 【悬赏金币】回答本帖问题，作者水天一色元将赠送您 20 个金币 | ||
[求助]
小白求教回复审稿人关于Gene Ontology方法的问题 已有1人参与
|
||
|
投稿BMC，由于对Gene Ontology富集分析不太了解，所以不知该怎么回复审稿人才好？ 其中一位审稿人提出 Question 2: The enrichment analysis is unclear, in particular as regards the GO classification. What are the used method and thresholds? Please clarify. Also as regards TF analysis, It is unclear if the classification and the difference among the samples are supported by an enrichment analysis. This must be clarified because in the absence of a statistical validation it is evident that the whole discussion is weak. 富集分析尚不清楚，尤其是在GO分类方面。使用的方法和阈值是什么？请澄清。此外，关于TF分析，还不清楚样品之间的分类和差异是否得到富集分析的支持。这一点必须澄清，因为在缺乏统计验证的情况下，整个讨论显然是薄弱的。 |
回复此楼» 猜你喜欢
恩诺沙星（Enrofloxacin）科研解析：分子特征、LC-MS/MS 检测与实验室使用要点
已经有0人回复
-
Calderasib理化性质与实验操作技术笔记
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有96人回复
-
RMC-6291怎么用？RAS(ON) 三重复合物工具化合物的实验室实操要点
已经有0人回复
-
苯并呋咱全解析：NBD 荧光衍生化试剂母核的化学特性与实验室应用
已经有0人回复
-
生物质炭与活化剂氢氧化钾混合注意事项
已经有0人回复
-
科研人必读：新一代 KRAS G12C 抑制剂 Olomorasib 的研究进展
已经有0人回复
-
BT-11（Omilancor）研究化合物全解析：从分子结构到实验应用要点
已经有0人回复
-
富马酸贝达喹啉：二芳基喹啉类工具化合物的化学特征
已经有0人回复
-
BT投稿with editor状态快两周了，正常吗
已经有25人回复
-
Silevertinib（BDTX-1535）结构拆解：炔基双环片段为何成为合成瓶颈
已经有0人回复
fuyuandj86
版主 (著名写手)
己所不欲，勿施于人
- 应助: 397 (硕士)
- 贵宾: 0.016
- 金币: 7854.5
- 散金: 522
- 红花: 60
- 沙发: 2
- 帖子: 1326
- 在线: 1452小时
- 虫号: 544795
- 注册: 2008-04-13
- 性别: GG
- 专业: 生物化学
- 管辖: 生物科学
【答案】应助回帖
感谢参与，应助指数 +1
|
把你做富集分析的参数，怎么排序的告诉他就行了。 你文章里对转录因子做富集分析了吗？听起来好像是审稿人要你对TF或者TF的靶基因做一个富集分析。不知道你文章里是怎么写的所以难以判断审稿人具体是什么意思。 另外，GSEA用的数学方法请阅读这篇PNAS：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1239896/ |
» 本帖已获得的红花（最新10朵）
水天一色元
2楼2020-11-22 13:54:08
3楼2020-11-22 17:47:29
4楼2020-11-23 10:54:50