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新虫 (初入文坛)

[求助] MS如何计算数密度(number density)分布：单位体积的原子/分子数已有1人参与

如图，文献要求由极性头中的硫原子和烷烃链上碳原子之间的距离分布来表示疏水烷烃链在界面处的分布和有序排列。
所求的就是不同距离上的数密度分布

通过询问他人得知，这个和求配位数的平均数密度值好像是类似的，但平均数密度值是手算，这个需要求出分布，应该是不能够手算的。
在此请教大佬，谢谢

1.png

1楼2020-11-08 16:16:56

木虫 (著名写手)

算径向分布函数，然后积分就得配位数。

如果是用Forcite模块跑的MD，那么Analysis里面就有径向分布函数

分子筛、分子动力学模拟，有问题可咨询我的知乎主页 https://www.zhihu.com/people/rao777

5楼2022-04-13 16:27:44

新虫 (小有名气)

3楼2021-11-11 09:28:24

新虫 (小有名气)

请问平均数密度怎么手算啊？

4楼2022-04-11 11:05:07