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sealanlan

铁虫 (正式写手)

[求助] QST2优化三天了,还没有结束,帮忙看下有没有问题 已有2人参与

优化一个分子闭环到开环的过渡态,第一次选择使用qst2进行优化,三天了,还没有跑完,我是应该截取中间态来做opt=ts呢?还是继续让它跑着呢?
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  • 2020-10-22 12:55:12, 4.02 M
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努力
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wolfzhong

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

估计还是你初始结构有问题,把要成环的2个原子固定在2A(或2.2A),优化后直接用ts试试?
4楼2020-11-07 22:46:09
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paramecium86

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
zhou2009: 金币+3 2020-10-23 18:59:44
sealanlan: 金币+10, ★★★很有帮助, 非常感谢,已经优化完了没得到结果,用了opt=ts还是偏离过渡态很远 2020-10-26 22:50:45
首先,你的计算只用到了一个核心。没用多核心并行。那算几天其实也就是算了几十步优化而已。  而且从优化的整体趋势来看  已经偏离开环的过渡态很远了,说明 通过初始和末态结构,QST2暴力求坐标差值的方法 并没有给出一个合理的结构,导致过渡态优化不出来。可以自己猜个结构 然后用OPT=TS 试试看。
2楼2020-10-22 13:24:33
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sealanlan

铁虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by paramecium86 at 2020-10-22 13:24:33
首先,你的计算只用到了一个核心。没用多核心并行。那算几天其实也就是算了几十步优化而已。  而且从优化的整体趋势来看  已经偏离开环的过渡态很远了,说明 通过初始和末态结构,QST2暴力求坐标差值的方法 并没有给 ...

做了势能面扫描,从中间截取了过渡态出来重新做了opt=ts,结果还没看到
努力
3楼2020-10-26 22:56:44
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