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三岁薇恩

新虫 (正式写手)

[求助] lammps跑计算时,开32核反而没有1个核跑得快? 已有2人参与

这是什么原因呢?
工作站是32核的(如图1,4颗8核的CPU)。怎么样才能让资源最大化?求指导。
每个算例跑48小时太伤了...也就是计算三四千个原子的热导率。

mpirun -n 32 lammps < in.A    1核 输入该命令这个算的时候只有1个核在跑

mpirun -n 32 lammps -in in.A  32核   输入该命令32个核都在跑

lammps跑计算时,开32核反而没有1个核跑得快?
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三岁薇恩

新虫 (正式写手)

急急急 是哪个环节出了问题,按道理不应该算这么久哇..
2楼2020-10-13 09:09:26
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jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
“三四千个原子”个数太少,不能发挥并行计算的优势,你要是搞三四万个原子,或者三四十万个原子再试试,并行计算肯定比1个核跑得快。
3楼2020-10-13 09:26:18
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aa小小佑

银虫 (职业作家)

原子数多,核数多才有用的,3000多原子实际上几个核就够处理了。

发自小木虫IOS客户端
4楼2020-10-13 09:26:20
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三岁薇恩

新虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2020-10-13 09:26:18
“三四千个原子”个数太少,不能发挥并行计算的优势,你要是搞三四万个原子,或者三四十万个原子再试试,并行计算肯定比1个核跑得快。

谢谢!但我感觉我的运行命令似乎不太对。像"mpirun -n 32 lammps < in.A" 中的“32”,我换成任何数字后台看都是只有1个核在跑,请问怎么修改运行命令?
5楼2020-10-13 10:36:12
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三岁薇恩

新虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by aa小小佑 at 2020-10-13 09:26:20
原子数多,核数多才有用的,3000多原子实际上几个核就够处理了。

好的!那我试试4个核或者8个核跑着试试,但其实和别人比较还是挺慢的,总感觉哪一块不对劲。
6楼2020-10-13 10:37:44
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aa小小佑

银虫 (职业作家)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 三岁薇恩 at 2020-10-13 10:37:44
好的!那我试试4个核或者8个核跑着试试,但其实和别人比较还是挺慢的,总感觉哪一块不对劲。...

可是是mpirun 的问题,换个看看

发自小木虫IOS客户端
7楼2020-10-13 11:57:36
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lyl453433939

金虫 (正式写手)

高性能设备软硬件集成商

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
跑的时候htop截个图看看
8楼2020-10-13 15:12:40
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hnu_wjl

银虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 三岁薇恩 at 2020-10-13 10:36:12
谢谢!但我感觉我的运行命令似乎不太对。像&quot;mpirun -n 32 lammps &lt; in.A&quot; 中的“32”,我换成任何数字后台看都是只有1个核在跑,请问怎么修改运行命令?...

如果只有一个核在跑应该是你的命令有问题。。。
9楼2020-10-13 15:16:26
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2009云飞扬

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 三岁薇恩 at 2020-10-13 10:36:12
谢谢!但我感觉我的运行命令似乎不太对。像&quot;mpirun -n 32 lammps &lt; in.A&quot; 中的“32”,我换成任何数字后台看都是只有1个核在跑,请问怎么修改运行命令?...

你用top指令看看就知道几个核在跑了

发自小木虫Android客户端
10楼2020-10-14 07:49:43
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