应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » lammps跑计算时，开32核反而没有1个核跑得快？
101/1返回列表
查看: 3767  |  回复: 9
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
【悬赏金币】回答本帖问题，作者三岁薇恩将赠送您 20 个金币

三岁薇恩

新虫 (正式写手)

[求助] lammps跑计算时，开32核反而没有1个核跑得快？ 已有2人参与

这是什么原因呢?
工作站是32核的（如图1,4颗8核的CPU）。怎么样才能让资源最大化？求指导。
每个算例跑48小时太伤了...也就是计算三四千个原子的热导率。

mpirun -n 32 lammps < in.A    1核 输入该命令这个算的时候只有1个核在跑

mpirun -n 32 lammps -in in.A  32核   输入该命令32个核都在跑

lammps跑计算时，开32核反而没有1个核跑得快？
1.jpg
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2020-10-13 09:08:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

三岁薇恩

新虫 (正式写手)
急急急 是哪个环节出了问题，按道理不应该算这么久哇..
赞一下 回复此楼
2楼2020-10-13 09:09:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
“三四千个原子”个数太少，不能发挥并行计算的优势，你要是搞三四万个原子，或者三四十万个原子再试试，并行计算肯定比1个核跑得快。
赞一下 回复此楼
3楼2020-10-13 09:26:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

aa小小佑

银虫 (职业作家)
原子数多，核数多才有用的，3000多原子实际上几个核就够处理了。

发自小木虫IOS客户端
赞一下 回复此楼
4楼2020-10-13 09:26:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

三岁薇恩

新虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2020-10-13 09:26:18
“三四千个原子”个数太少，不能发挥并行计算的优势，你要是搞三四万个原子，或者三四十万个原子再试试，并行计算肯定比1个核跑得快。

谢谢!但我感觉我的运行命令似乎不太对。像"mpirun -n 32 lammps < in.A" 中的“32”，我换成任何数字后台看都是只有1个核在跑，请问怎么修改运行命令？
赞一下 回复此楼
5楼2020-10-13 10:36:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

三岁薇恩

新虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by aa小小佑 at 2020-10-13 09:26:20
原子数多，核数多才有用的，3000多原子实际上几个核就够处理了。

好的！那我试试4个核或者8个核跑着试试，但其实和别人比较还是挺慢的，总感觉哪一块不对劲。
赞一下 回复此楼
6楼2020-10-13 10:37:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

aa小小佑

银虫 (职业作家)
引用回帖:
6楼: Originally posted by 三岁薇恩 at 2020-10-13 10:37:44
好的！那我试试4个核或者8个核跑着试试，但其实和别人比较还是挺慢的，总感觉哪一块不对劲。...

可是是mpirun 的问题，换个看看

发自小木虫IOS客户端
赞一下 回复此楼
7楼2020-10-13 11:57:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lyl453433939

金虫 (正式写手)

高性能设备软硬件集成商

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
跑的时候htop截个图看看
赞一下 回复此楼
8楼2020-10-13 15:12:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hnu_wjl

银虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 三岁薇恩 at 2020-10-13 10:36:12
谢谢!但我感觉我的运行命令似乎不太对。像&quot;mpirun -n 32 lammps &lt; in.A&quot; 中的“32”，我换成任何数字后台看都是只有1个核在跑，请问怎么修改运行命令？...

如果只有一个核在跑应该是你的命令有问题。。。
赞一下 回复此楼
9楼2020-10-13 15:16:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

2009云飞扬

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 三岁薇恩 at 2020-10-13 10:36:12
谢谢!但我感觉我的运行命令似乎不太对。像&quot;mpirun -n 32 lammps &lt; in.A&quot; 中的“32”，我换成任何数字后台看都是只有1个核在跑，请问怎么修改运行命令？...

你用top指令看看就知道几个核在跑了

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
10楼2020-10-14 07:49:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 三岁薇恩 的主题更新
101/1返回列表
不应助 确定回帖应助 (注意：应助才可能被奖励，但不允许灌水，必须填写15个字符以上)
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 5个%2F，非固定段22个字母 +12 jaasxulu 2026-07-15 13/650 2026-07-19 21:04 by lfy8008
[硕博家园] 售T0P一区SCI文章，我:8O5.51.O.54,科目齐全,可＋急 +4 bjm2e4yior 2026-07-18 4/200 2026-07-19 20:50 by mxyes0ckns
[考博] 售T0P一区SCI文章，我:8O5.51.O.54,科目齐全,可＋急 +3 ufgqpyvpi6 2026-07-18 4/200 2026-07-19 20:43 by mxyes0ckns
[考博] 售T0P一区SCI文章，我:8O5.51.O.54,科目齐全,可＋急 +4 ufgqpyvpi6 2026-07-18 5/250 2026-07-19 20:19 by mxyes0ckns
[基金申请] 售T0P一区SCI文章，我:8O5.51.O.54,科目齐全,可＋急 +3 ufgqpyvpi6 2026-07-18 5/250 2026-07-19 20:14 by mxyes0ckns
[论文投稿] 售T0P一区SCI文章，我:8O5.51.O.54,科目齐全,可＋急 +3 ufgqpyvpi6 2026-07-18 5/250 2026-07-19 20:10 by mxyes0ckns
[考研] 售T0P一区SCI文章，我:8O5.51.O.54,科目齐全,可＋急 +4 ufgqpyvpi6 2026-07-18 7/350 2026-07-19 20:10 by mxyes0ckns
[硕博家园] 售T0P一区SCI文章，我:8O5.51.O.54,科目齐全,可＋急 +4 ufgqpyvpi6 2026-07-18 5/250 2026-07-19 20:03 by mxyes0ckns
[基金申请] 小木虫没落了，除了祈祷帖子，几乎看不到有价值的帖子 +15 botar 2026-07-14 16/800 2026-07-19 18:23 by wowsunflower
[基金申请] 国社科通讯评审 +5 潜水冠军123 2026-07-18 6/300 2026-07-19 12:28 by lfy8008
[基金申请] 生命口C13面上会评时间 +7 luckinging 2026-07-14 11/550 2026-07-17 20:43 by 虫卜1988
[基金申请] 生命口面上会评结束了吗大家有知道结果吗？现在还没有结果正常不？ +6 碧水00 2026-07-16 9/450 2026-07-17 15:21 by jaasxulu
[论文投稿] 投英文期刊如何查重 10+5 不知道取什么名� 2026-07-15 6/300 2026-07-17 09:07 by bobvan
[有机交流] 伯胺上甲基求助 100+4 002tmumu 2026-07-14 7/350 2026-07-16 19:47 by 002tmumu
[论文投稿] 跨出版社商投稿 20+5 倪好520 2026-07-13 5/250 2026-07-16 17:24 by 无视军团
[基金申请] 生生命学部会评 +4 wuke100666 2026-07-15 4/200 2026-07-16 00:12 by 啦啦小妮子
[基金申请] 会评 +5 无名者登山 2026-07-15 5/250 2026-07-15 18:15 by 杠就是你对
[基金申请] E口青C会评结束了吗？ 40+3 小小书虫c 2026-07-14 9/450 2026-07-15 16:04 by 安静的知了
[基金申请] 国自然面上D口祈祷 +4 monkeynana 2026-07-14 4/200 2026-07-15 09:14 by 白水煮
[基金申请] 没收到消息，再次陪跑 +3 天空星辰fly 2026-07-14 3/150 2026-07-14 19:14 by 6543yes
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭