| 查看: 900 | 回复: 0 | |||
[交流]
【小工具教程】识别结合位点
|
|
用途 采用GHECOM等算法识别蛋白质/核酸中潜在的小分子结合位点,输出文件可用于分子对接定义口袋。 入口 平台地址:https://cloud.yinfotek.com/ 功能入口:左侧菜单栏【计算方案】->【小工具】->【分子结构】->【识别结合位点】 步骤 1.上传受体文件,点击【检测位点】 上传处理好的蛋白质/核酸受体结构文件,可参考【处理PDB结构】。 2.浏览位点分布情况 表格上方的标签为 算法名称,表中给出了各位点 编号和对应的 容积。点击某一行,右侧视图即实时显示位点(用一堆小球展示)的位置。 a.通常来说,容积较大的位点更有可能真正的位点。将受体的表现形式改为 surface,可更直观展示位点所在的空腔形状。 b.后期会继续增加位点识别算法,通过比较多个算法的位点,提高预测准确度。 3.选择位点,点击【下载文件】 该文件可直接用于分子对接定义口袋。 |
» 猜你喜欢
散金币祈福
已经有187人回复
求助,如何提取ELK的rt-TDDFT在某一时刻的自旋密度分布和电子密度分布
已经有1人回复
物理学I论文润色/翻译怎么收费?
已经有228人回复
澳门大学IAPME李海峰教授常年招收博士研究生
已经有0人回复
澳门大学IAPME李海峰教授常年招收博士研究生
已经有0人回复
澳门大学IAPME李海峰教授常年招收博士研究生
已经有0人回复
深圳大学应用技术学院招聘凝聚态物理博士后
已经有118人回复
深圳大学2027级光电信息工程/物理学研究生推免
已经有70人回复
求助中医院临床中医中标的青年标书学习,谢谢
已经有4人回复
浙大物院表面物理课题组长期招收普博及直博学生
已经有257人回复
【征稿】Springer Nature热电专题 Discover Materials / Discover Chemistry
已经有47人回复










回复此楼