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【小工具教程】识别结合位点
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用途 采用GHECOM等算法识别蛋白质/核酸中潜在的小分子结合位点，输出文件可用于分子对接定义口袋。 入口 平台地址：https://cloud.yinfotek.com/ 功能入口：左侧菜单栏【计算方案】->【小工具】->【分子结构】->【识别结合位点】 步骤 1.上传受体文件，点击【检测位点】 上传处理好的蛋白质/核酸受体结构文件，可参考【处理PDB结构】。 2.浏览位点分布情况 表格上方的标签为 算法名称，表中给出了各位点 编号和对应的 容积。点击某一行，右侧视图即实时显示位点（用一堆小球展示）的位置。 a.通常来说，容积较大的位点更有可能真正的位点。将受体的表现形式改为 surface，可更直观展示位点所在的空腔形状。 b.后期会继续增加位点识别算法，通过比较多个算法的位点，提高预测准确度。 3.选择位点，点击【下载文件】 该文件可直接用于分子对接定义口袋。  |
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