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dummy1木虫 (正式写手)
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【求助】磁盘空间不足？
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input： %chk=full.chk %mem=4500mb %nproc=8 # MaxDisk=300GB opt mp2/cc-pVTZ direct freq nosymm SCF=(Maxconventionalcycles=300) title 1 2 S 5.28630000 7.44080000 6.92010000 。。。。。。。。。。。。 C 8.92810000 6.09180000 7.68820000 C 7.19550000 7.31250000 9.02210000 C 6.79930000 7.05170000 7.74210000 H 9.82580000 5.58490000 7.36600000 output： 。。。。。。。。。。。。。 Range of M.O.s used for correlation: 81 1120 NBasis= 1120 NAE= 160 NBE= 159 NFC= 80 NFV= 0 NROrb= 1040 NOA= 80 NOB= 79 NVA= 960 NVB= 961 **** Warning!!: The largest alpha MO coefficient is 0.19243293D+02 **** Warning!!: The largest beta MO coefficient is 0.18269809D+02 Disk-based method using ON**2 memory for 14 occupieds at a time. Estimated scratch disk usage= 36728824704 words. Actual scratch disk usage= 36220118400 words. Erroneous write. Write 4096 instead of 12288. fd = 4 orig len = 12288 left = 12288 g_write 不加 MaxDisk=300GB ，direct 错误也出现。 看了以下sctrach 文件，也达到了几百G， 各位有遇到得吗？ 如何解决啊？救救我吧， 实在没辙了！！ |
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Estimated scratch disk usage= 36728824704 words. Actual scratch disk usage= 36220118400 words. 这两句话一出，原因就很明显了，就是磁盘空间不足了 解决方法1：再挂一个硬盘（双硬盘工作） 解决方法2：换大硬盘 解决方法3：简化体系 解决方法4：降低基组，或者采用混合基组 解决方法5：降低方法，或者采用分层计算 |
2楼2009-07-20 14:33:29
dummy1
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3楼2009-07-20 16:04:28
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限制使用太大的磁盘？问这个问题，说明楼主对高斯的运行原理不是太了解。 楼主有没有想过为什么硬盘使用量大呢？那是因为你所采用的方法基组，处理你这个体系，需要很大的临时数据区，这些临时数据无法在内存中全部放下，所以Gaussian决定把这些数据写入硬盘，等到需要的时候再读出来。也就是说，对于你这个任务来说，你的硬盘太小了。如果这些临时数据在内存中存不下，你又不让这些数据写入硬盘，那么请问楼主，你想让Gaussian把这些数据写到哪里去呢》 |
4楼2009-07-20 17:16:12
dummy1
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7楼2009-07-21 09:20:00
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你40多个体系用这么大的基组和这么高的方法，硬盘是肯定承受不了的 可能试试对不同的原子定义不同的基组会好些，不用分层。对核心的原子用当前的cc-pVTZ（不要多于5个），对外围的原子，用6-31G*或者cc-pVDZ，可能会好些。原则上这样的话你还是不能算频率，因为频率对硬盘的需求更大，大概要比优化多5-7倍。 如果你内存足够大，你可以使用MP2=fulldirect，然后把内存定义到比如50GB，可能会大大减小硬盘的需求。不过我认为要想对你的体系用这个方法，好像国内还没有几个计算组能有这个条件。 |
8楼2009-07-21 10:00:45
dummy1
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9楼2009-07-21 10:57:33
