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请问各位大神,如何比较细致地分析BDP数据库中的已有蛋白的结构信息
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| RT,主要是分析蛋白质与小分子的相互作用。很多这种Co-crystal的文章侧重于化合物,对于结构没有较为详细解读。那么想请问一下各位大神,根据pdb数据库中的结构,要怎么分析得出小分子与蛋白之间的相互作用(包括掩埋空间、氢键、疏水作用、盐桥、范德华力等)。并且还想请教一下大家,这种蛋白质与小分子的共晶结构,除了相互作用,还有些什么信息可以解读。希望大家可以帮帮孩子,解解疑惑,不胜感激! |
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