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合合?合

新虫 (小有名气)

[求助] 计算有机荧光分子的吸收光谱和发射光谱已有1人参与

最近正在合一个有机荧光探针,是根据文献中报道的简单的官能团反应,但是这种有机化学物质没有报道过,因此想跑个高斯计算,这种物质是否可以稳定存在,以及它的发射光谱和吸收光谱,请各位小木虫计算大佬赐教,感谢感谢!!!

@jiewei 发自小木虫Android客户端
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paramecium86

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

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小红豆: 金币+10, 应助指数+1, 应助 2020-09-18 12:46:52
一个分子是不是稳定存在这个说法很模糊。至少高斯通过OPT FREQ进行几何优化和频率计算后得到的 没有虚频的结构可以认为是势能面上的某一个低点,相对于过渡态来说是一种稳定的结构。至于你要考虑其它的比如热稳定性,光稳定性之类的就得考虑其他类型的计算,然后进行讨论了。

荧光的计算属于激发态计算,比较容易得到的是通过TDDFT方法计算垂直激发能(对应吸收光谱),发射能(对应荧光光谱)。具体比较入门和基础的部分可以看我这个教程1.5节 https://muchong.com/t-14242735-1,截图如下

教程中只是最最基础的部分。如果还需要考虑平衡溶剂之类的步骤还要更加复杂一些。
计算有机荧光分子的吸收光谱和发射光谱
激发态1.png


计算有机荧光分子的吸收光谱和发射光谱-1
激发态2.png


计算有机荧光分子的吸收光谱和发射光谱-2
激发态3.png


计算有机荧光分子的吸收光谱和发射光谱-3
激发态4.png

2楼2020-09-14 23:36:58
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