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静静的泪滴

铜虫 (初入文坛)

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专业: 环境微生物学

[求助] 有什么软件可以同时比对约2万条序列？

1. 序列长度20000bp
2. 序列数量20000条
3. 数据包约600M
请大神赐教。这种怎么比？

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1楼 2020-09-12 11:07:33

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BioChen

银虫 (正式写手)

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专业: 生物信息学

提问要详细点吧，比如你这2万条2万bp的序列要怎么比对？你比对的目的是什么？

2楼2020-09-12 17:24:08

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xn8008

至尊木虫 (知名作家)

Balance Angel

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软件倒是有，不过需要你准备两个东西，第一是申请国家计算机中心的超大计算机，第二是你需要编一下程序，预计600m的需要4天完成

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奋斗是我们前进的动力！

3楼2020-09-12 18:45:59

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Creek0501

铜虫 (初入文坛)

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专业: 生物信息学

blast、blat

4楼2020-09-13 14:51:40

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jurkat.1640

至尊木虫 (文坛精英)

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比对后你怎么出图？没图等于0

5楼2020-09-14 14:01:42

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