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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 请教各路大神指点R语言问题
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水逝雁南飞

新虫 (小有名气)

[求助] 请教各路大神指点R语言问题 已有1人参与

请教各路大神，我在R4.0.2里面运行affy的时候总是出现报错，显示package ‘affy’ is not available (for R version 4.0.2)，好不容易下载下来了，运行library("affy"的时候，又是各种报错，具体如图所示。求各位大神帮帮忙，指点一下吧

请教各路大神指点R语言问题
QQ图片20200907151551.png
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1楼 2020-09-07 16:02:55
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水逝雁南飞

新虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by Creek0501 at 2020-09-08 08:59:18
需要贴具体信息...

下载这两个包就会提示这个
请教各路大神指点R语言问题-1
QQ图片20200908162507.png
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7楼2020-09-08 16:26:39
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普通回帖

Creek0501

铜虫 (初入文坛)
没有报错
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2楼2020-09-07 17:07:57
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水逝雁南飞

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by Creek0501 at 2020-09-07 17:07:57
没有报错

请问大神，这个代表什么意思呢？
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3楼2020-09-07 17:09:59
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Creek0501

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 水逝雁南飞 at 2020-09-07 17:09:59
请问大神，这个代表什么意思呢？...

加载依赖的其他lib时候的运行信息
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4楼2020-09-07 17:38:39
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水逝雁南飞

新虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by Creek0501 at 2020-09-07 17:38:39
加载依赖的其他lib时候的运行信息...

但是我也尝试添加其他的程序包，一直都是 is not available
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5楼2020-09-07 19:26:43
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Creek0501

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 水逝雁南飞 at 2020-09-07 19:26:43
但是我也尝试添加其他的程序包，一直都是 is not available...

需要贴具体信息
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6楼2020-09-08 08:59:18
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BioChen

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ...
感谢参与，应助指数 +1
水逝雁南飞: 金币+100, ★★★很有帮助 2020-09-08 19:46:21
有一些包不能通过install.package()函数安装，特别是生物相关的包，它们大多通过Bioconductor安装。

比如BiocGenerics的安装方法是：

if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
    install.packages("BiocManager"

BiocManager::install("BiocGenerics"

即先通过install.package()函数安装BiocManager，再通过BiocManager::install()函数安装BiocGenerics。
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8楼2020-09-08 17:20:55
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水逝雁南飞

新虫 (小有名气)
引用回帖:
8楼: Originally posted by BioChen at 2020-09-08 17:20:55
有一些包不能通过install.package()函数安装，特别是生物相关的包，它们大多通过Bioconductor安装。

比如BiocGenerics的安装方法是：

if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRU ...

您好，请问我在下载Biocbase包的时候出现这个提示，应该怎么办呢？
请教各路大神指点R语言问题-2
QQ图片20200908194913.png
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9楼2020-09-08 19:50:29
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Creek0501

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
9楼: Originally posted by 水逝雁南飞 at 2020-09-08 19:50:29
您好，请问我在下载Biocbase包的时候出现这个提示，应该怎么办呢？

QQ图片20200908194913.png
...

可以用源码/编译好的文件安装
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10楼2020-09-09 09:00:39
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