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849621108

新虫 (小有名气)

[求助] QE-ralex计算耗时过高求助

各位老师好,本人用QE对Fe(110)表面吸附胆碱分子(共57个原子)进行优化耗时过高已算18小时(36核机子,指定24核进行计算)先前已搭建2层Fe(110)进行优化计算,5小时就能算完,结果收敛。不明白为什么加了几个分子就算的这么费劲了,还请大家帮忙分析指出问题
1. 输入文件是否需要修改,萌新一枚还需要多多学习
2. 关于K点的设置一直不明白该如何设置,本人只想优化后进行自洽计算,得到分子和表面的结合能
3. 看结果已经得到 !total energy =   ,为何又进行了几次计算,一直没结束   

输入文件如下:
&CONTROL
    calculation   = "relax"
    forc_conv_thr =  1.00000e-03
    max_seconds   =  1.72800e+05
    nstep         = 100
    outdir        = "./out/"
    prefix        = "Fe"
    pseudo_dir    = "./pseudo/"
/

&SYSTEM
    a                         =  8.54435e+00
    b                         =  1.20835e+01
    c                         =  2.20139e+01
    degauss                   =  1.00000e-02
    ecutrho                   =  7.20000e+02
    ecutwfc                   =  7.10000e+01
    ibrav                     = 8
    nat                       = 57
    nbnd                      = 560
    nspin                     = 2
    ntyp                      = 5
    occupations               = "smearing"
    smearing                  = "gaussian"
    starting_magnetization(1) =  2.00000e-01
/

&ELECTRONS
    conv_thr         =  1.00000e-06
    electron_maxstep = 200
    mixing_beta      =  4.00000e-01
    startingpot      = "atomic"
    startingwfc      = "atomic+random"
/

&IONS
    ion_dynamics = "bfgs"
/

&CELL
/

K_POINTS {gamma}

ATOMIC_SPECIES
Fe     55.84500  Fe.pbe-spn-rrkjus_psl.1.0.0.UPF
C      12.01070  C.pbe-n-rrkjus_psl.1.0.0.UPF
O      15.99940  O.pbe-n-rrkjus_psl.1.0.0.UPF
H       1.00794  H.pbe-rrkjus_psl.1.0.0.UPF
N      14.00674  N.pbe-n-rrkjus_psl.1.0.0.UPF

ATOMIC_POSITIONS {angstrom}
Fe      1.424026   0.000000   3.199978
Fe      0.000000   2.013858   3.199969
Fe      0.000000   0.000000   1.281726  0 0 0
Fe      1.424058   2.013922   1.281726  0 0 0
Fe      1.424028   4.027940   3.199913
Fe      0.000000   6.041766   3.199919
Fe      0.000000   4.027844   1.281726  0 0 0
Fe      1.424058   6.041766   1.281726  0 0 0
Fe      1.424028   8.055592   3.199913
Fe      0.000000  10.069675   3.199969
Fe      0.000000   8.055688   1.281726  0 0 0
Fe      1.424058  10.069611   1.281726  0 0 0
Fe      4.272174   0.000000   3.199966
Fe      2.848090   2.013858   3.199947
Fe      2.848116   0.000000   1.281726  0 0 0
Fe      4.272174   2.013922   1.281726  0 0 0
Fe      4.272174   4.027940   3.199908
Fe      2.848090   6.041766   3.199903
Fe      2.848116   4.027844   1.281726  0 0 0
Fe      4.272174   6.041766   1.281726  0 0 0
Fe      4.272174   8.055592   3.199908
Fe      2.848090  10.069675   3.199947
Fe      2.848116   8.055688   1.281726  0 0 0
Fe      4.272174  10.069611   1.281726  0 0 0
Fe      7.120322   0.000000   3.199978
Fe      5.696258   2.013858   3.199947
Fe      5.696232   0.000000   1.281726  0 0 0
Fe      7.120290   2.013922   1.281726  0 0 0
Fe      7.120320   4.027940   3.199913
Fe      5.696258   6.041766   3.199903
Fe      5.696232   4.027844   1.281726  0 0 0
Fe      7.120290   6.041766   1.281726  0 0 0
Fe      7.120320   8.055592   3.199913
Fe      5.696258  10.069675   3.199947
Fe      5.696232   8.055688   1.281726  0 0 0
Fe      7.120290  10.069611   1.281726  0 0 0
N       5.207106   6.379566   9.490652
C       4.458808   5.274458   8.788986
H       4.466925   5.504868   7.722789
H       5.027292   4.356460   8.939624
C       5.344448   6.105289  10.970915
H       5.871006   6.956905  11.405325
H       4.352568   6.009537  11.406872
H       5.934319   5.200383  11.106221
C       4.542290   7.719280   9.299953
H       3.583093   7.721465   9.812374
H       5.197316   8.476850   9.734927
H       4.399315   7.890241   8.233444
C       6.592575   6.454392   8.891952
H       6.498674   6.693765   7.833590
H       7.072934   5.487661   9.021847
H       7.378590   7.242216   9.160463
C       3.015406   5.040035   9.222742
H       2.962920   4.724101  10.270916
H       2.410084   5.946501   9.101761
O       2.572384   4.009714   8.353457
H       1.673974   3.758595   8.592521
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读不下去就run

新虫 (初入文坛)

打乱对称性了,算得慢很正常,本来优化就是一点一点优化的。

发自小木虫IOS客户端
3楼2024-04-24 23:00:46
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