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漫天飘雪

版主 (知名作家)

[交流] 计算normalized trace of interatomic force constant tensors的小程序

介绍
a post-processing code can calculate normalized trace of interatomic force constant tensors versus atomic distances from force_constants produced by phonopy. refer: nat. commun., 2014, 5, 3525.
计算normalized trace of interatomic force constant tensors的小程序

具体公式
the interatomic force constant (ifc) tensor from first-principles calculation is
计算normalized trace of interatomic force constant tensors的小程序-1
where e and rα represent energy and atomic position along α direction, respectively. by taking
trace of ifc tensors, we can assess bonding stiffness regardless of crystal structure or coordinate
system.
计算normalized trace of interatomic force constant tensors的小程序-2
finally, we need to normalize the trace values of many materials to compare their interaction
ranges as in fig. 3, since different materials have slightly different bonding stiffness. the
normalization is done by the trace value of self-interaction force_constants.
计算normalized trace of interatomic force constant tensors的小程序-3

###########
useage:
###########
1. chmod +x trace_ifc.x
2. phonon calculations with phonopy.
3. ./trace_ifc.x (it reads force_constants and sposcar produced by phonopy)
4. plot trace_ifc.dat with gunplot, python, or freemat and so on.
5. trace_ifc.dat 格式说明
计算normalized trace of interatomic force constant tensors的小程序-4
计算normalized trace of interatomic force constant tensors的小程序-5

[ Last edited by 漫天飘雪 on 2020-9-5 at 10:39 ]
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    • 2020-09-02 17:12:35, 176.4 K

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1楼 2020-09-02 17:20:13
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回帖置顶 ( 共有1个 )

漫天飘雪

版主 (知名作家)
漫天飘雪: 回帖置顶 2023-03-13 17:32:24
程序已经集成到vaspkit里面了，可以通过命令vaspkit -task 738使用！！！！！！！！！！
赞一下 回复此楼
16楼2023-03-13 17:31:14
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考拉VS博比

木虫 (正式写手)
★
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厉害

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5楼2020-09-03 07:03:31
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raolixiang

新虫 (正式写手)
★
漫天飘雪(金币+1): 谢谢参与
送红花一朵
谢谢你
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11楼2020-09-12 15:23:24
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raolixiang

新虫 (正式写手)
不太会分析，图都做不出来，有高手指导一下吗
赞一下 回复此楼
12楼2020-09-12 20:18:11
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倔强的坚果墙

铁杆木虫 (正式写手)
★
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刘老师就是霸气！
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13楼2022-03-29 18:24:58
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逆流的船123

新虫 (初入文坛)
★
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送红花一朵
感谢！
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14楼2022-09-27 13:41:04
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calos8182楼
2020-09-02 17:25   回复  
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牛！
123dingyc3楼
2020-09-02 19:03   回复  
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牛 发自小木虫IOS客户端
xiaoqiuqiu204楼
2020-09-02 20:05   回复  
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hbabc6楼
2020-09-03 07:18   回复  
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tzynew7楼
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云在青天8楼
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苏州华博9楼
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miaojiabing10楼
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万达2021010815楼
2023-03-13 16:37   回复  
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