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单单单1234

新虫 (小有名气)

[求助] IRC路径 已有1人参与

gaussian中过渡态输出结构的IRC路径与想要的相反，反应物变成了产物，产物变成了反应物，是什么原因，应该怎么办呢？

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1楼 2020-09-02 10:38:01
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paramecium86

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
zhou2009: 金币+5 2020-09-03 10:05:26
IRC路径本身计算并不会区分哪边是产物那边是反应物。这种存在过渡态的反应都是微观上可逆的。而反应往那边进行这都是人为去规定的。并不需要修正什么。只要两侧的结构跟实际反应中这个过渡态连接的两侧是一样的结构就行。至于这个反应向左还是向右根本都无所谓。而且作图的时候可以导出数据  坐标轴随意都可以翻转 你想谁在左边 谁在右边都可以。  （可以用irc中的phase关键词指定一个方向为正向，但是并没有什么必要）
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2楼2020-09-02 11:58:57
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单单单1234

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by paramecium86 at 2020-09-02 11:58:57
IRC路径本身计算并不会区分哪边是产物那边是反应物。这种存在过渡态的反应都是微观上可逆的。而反应往那边进行这都是人为去规定的。并不需要修正什么。只要两侧的结构跟实际反应中这个过渡态连接的两侧是一样的结构 ...

就是说，对结果没有什么影响对吗？

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3楼2020-09-02 15:30:58
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paramecium86

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

嗯 IRC重点是考察当前TS的两侧相连的中间体是否是符合反应路径即可。IRC的图上 谁在左边谁在右边没有关系。
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4楼2020-09-02 15:41:38
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单单单1234

新虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by paramecium86 at 2020-09-02 15:41:38
嗯 IRC重点是考察当前TS的两侧相连的中间体是否是符合反应路径即可。IRC的图上 谁在左边谁在右边没有关系。

好的，谢谢你

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5楼2020-09-02 15:42:43
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