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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » 【求助】请教torque问题
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TIGERYZZ

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助】请教torque问题

各位，我们集群使用torque管理，然后计算结果要在计算完毕后输出e，o文件。
想请问能否采用qstat或者别的命令，随时查看到正在运行的任务的屏幕输出，以便及时调整，谢谢。
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1楼2009-07-17 22:10:03
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fengya0785

银虫 (小有名气)
★ ★
TIGERYZZ(金币+1,VIP+0):thanks~~ 7-20 21:53
mingdong(金币+1,VIP+0):感谢交流！ 8-2 08:34
torque好像是没有这功能，但你可以在提交时重定向输出到文件里，就可以看到屏幕输出了。
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E
2楼2009-07-20 15:04:45
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ma_chao

新虫 (初入文坛)
★ ★
mingdong(金币+1,VIP+0):感谢交流！ 8-2 08:34
TIGERYZZ(金币+1,VIP+0): 8-2 10:53
重定向到文件，然后可以用watch + cat 来自动重复看

可以用，但不确定对资源的损耗

呵呵，fengya0785  
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3楼2009-08-02 03:32:04
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solocheng

荣誉版主 (文坛精英)

黑洞洞主

优秀版主
过来学习了，厉害
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你来了，我信你不会走；你走了，我当你没来过。
4楼2009-08-02 12:01:10
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fengya0785

银虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by ma_chao at 2009-8-2 03:32:
重定向到文件，然后可以用watch + cat 来自动重复看

可以用，但不确定对资源的损耗

呵呵，fengya0785  

5楼2009-08-03 11:31:56
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TIGERYZZ

金虫 (小有名气)
还请教个问题
我能否在作业运行过程中，更改作业的时间呢？
也就是更改提交作业时的walltime呢？
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6楼2009-08-05 08:13:47
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123qweasd7962

★ ★ ★ ★ ★ ★
wuli8(金币+3,VIP+0):3KS 8-20 13:36
TIGERYZZ(金币+3,VIP+0):这个是perl写的？好专业……好好看看去，谢谢了 8-20 21:00
可以参考使用qpeek

#!/usr/bin/perl

# qpeek:  Peek into a job's output spool files
# Copyright 2001, Ohio Supercomputer Center
#
# Usage:  qpeek [options] JOBID
#
# Options:
#   -c      Show all of the output file ("cat", default)
#   -h      Show only the beginning of the output file ("head"
#   -t      Show only the end of the output file ("tail"
#   -f      Show only the end of the file and keep listening ("tail -f"
#   -#      Show only # lines of output
#   -e      Show the stderr file of the job
#   -o      Show the stdout file of the job
#   -?      Display help

$tool="cat";
$numlines="";
$suffix="OU";
$spool="/var/spool/pbs/spool";
$host="oscbw";

while ( $ARGV[0] =~ /^-.*/ )
  {
    if ( $ARGV[0] eq "-c" )
      {
        $tool="cat";
      }
    elsif ( $ARGV[0] eq "-f" )
      {
        $tool="tail -f";
      }
    elsif ( $ARGV[0] eq "-h" )
      {
        $tool="head";
      }
    elsif ( $ARGV[0] eq "-t" )
      {
        $tool="tail";
      }
    elsif ( $ARGV[0] =~ /^-[0-9]+$/ )
      {
        $numlines=$ARGV[0];
      }
    elsif ( $ARGV[0] eq "-e" )
      {
        $suffix="ER"
      }
    elsif ( $ARGV[0] eq "-o" )
      {
        $suffix="OU"
      }
    elsif ( $ARGV[0] eq "-?" || $ARGV[0] eq "-help" )
      {
        print STDERR < qpeek:  Peek into a job's output spool files

Usage:  qpeek [options] JOBID

Options:
   -c      Show all of the output file ("cat", default)
   -h      Show only the beginning of the output file ("head"
   -t      Show only the end of the output file ("tail"
   -f      Show only the end of the file and keep listening ("tail -f"
   -#      Show only # lines of output
   -e      Show the stderr file of the job
   -o      Show the stdout file of the job (default)
   -?      Display this help message
EOF
        exit;
      }
    else
      {
        print STDERR "qpeek:  Unrecognized option $ARGV[0] ignored\n";
      }
    shift(@ARGV);
  }

$jobid=shift(@ARGV);
$jobid=~s/\.[A-z0-9.]+$//;
die "No jobid given!\n" if ( $jobid eq "" );

$node=&mothersuperior($jobid);
die "Job $jobid is not running!\n" if ( $node eq "" );

exec "rsh $node $tool $numlines $spool/$jobid.$host.$suffix\n";


sub mothersuperior
{
  local($jobid,$node);
  $jobid=$_[0];
  $node="";
  open(QSTAT,"qstat -f $jobid |";
  while ( )
    {
      chop;
      if ( $_ =~ /exec_host/ )
        {
          ($keyword,$node)=split(/=/);
          $node=~s:/[0-9]+[A-z0-9/+]*::;
        }
    }
  $node;
}

[ Last edited by 123qweasd7962 on 2009-8-20 at 11:47 ]
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7楼2009-08-20 11:44:23
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