| 查看: 1079 | 回复: 0 | |||
[交流]
使用MolAICal进行药物的QSAR计算
|
|
脢鹿脫脙MolAICal陆酶脨脨脪漏脦茂碌脛QSAR录脝脣茫 赂眉露脿陆脤鲁脤拢篓潞卢脫垄脦脛陆脤鲁脤拢漏脟毛录没脠莽脧脗拢潞 MolAICal鹿脵路陆脰梅脪鲁拢潞https://molaical.github.io MolAICal 脦脛脮脗陆茅脡脺拢潞https://doi.org/10.1093/bib/bbaa161 MolAICal脰脨脦脛虏漏驴脥拢潞https://molaical.github.io/cntutorial.html MolAICal blogspot拢潞https://qblab.blogspot.com 1. 录貌陆茅 脪漏脦茂碌脛露篓脕驴鹿鹿脧贸鹿脴脧碌(QSAR)掳眉潞卢脧脽脨脭禄脴鹿茅潞脥路脰脌脿拢卢脭脷卤戮陆脤鲁脤脰脨脩隆脫脙STAT3碌掳掳脳掳脨碌茫碌脛脪漏脦茂路脰脳脫脳梅脦陋脩脨戮驴露脭脧贸拢禄STAT3脢脟脰脦脕脝掳漏脰垄碌脛脪禄赂枚脰脴脪陋碌掳掳脳掳脨碌茫拢卢脩脨戮驴STAT3脪漏脦茂碌脛脢么脨脭拢卢脫脨脰煤脫脷脡猫录脝潞脧脌铆碌脛驴鹿掳漏脪漏脦茂隆拢 2. 鹿陇戮脽 2.1. 脣霉脨猫脠铆录镁 1) MolAICal: https://molaical.github.io 2) DRAGON: https://www.talete.mi.it/index.htm 脳垄脪芒拢潞鲁媒脕脣脫脙DRAGON脣茫脪漏脦茂路脰脳脫碌脛脙猫脢枚路没脥芒拢卢DRAGON脢么脫脷脡脤脪碌脠铆录镁拢卢脛茫驴脡脪脭脢鹿脫脙脠脦潞脦潞脧脢脢碌脛脠铆录镁脣茫路脰脳脫碌脛脙猫脢枚路没隆拢 2.2. 虏脵脳梅脣霉脨猫碌脛脢戮脌媒脦脛录镁 1) 卤戮陆脤鲁脤脣霉脨猫碌脛陆脤鲁脤脦脛录镁驴脡脪脭麓脫脪脭脧脗脥酶脰路脧脗脭脴: https://github.com/MolAICal/tutorials/tree/master/006-QSAR 3. 虏陆脰猫 3.1. 录脝脣茫路脰脳脫脙猫脢枚路没 1) 麓貌驴陋DRAGON脠铆录镁拢卢脠禄潞贸脭脷脦脛录镁录脨隆掳006-QSAR/ligands隆卤脰脨碌录脠毛脜盲脤氓脦脛录镁拢篓脠莽脥录1脣霉脢戮拢漏拢卢卤戮陆脤鲁脤碌脛脜盲脤氓脦脛录镁脢脟.hin赂帽脢陆碌脛脦脛录镁拢卢.hin赂帽脢陆碌脛脦脛录镁脢脟戮颅鹿媒HyperChem脠铆录镁脫脜禄炉鹿媒潞贸碌脛脛卢脠脧脦脛录镁赂帽脢陆隆拢脛茫脪虏驴脡脪脭脫脜禄炉脳脭录潞碌脛脜盲脤氓路脰脳脫拢卢脠禄潞贸卤拢麓忙鲁脡Sybyl Mol2赂帽脢陆碌脛脦脛录镁脫脙脫脷陆酶脪禄虏陆碌脛录脝脣茫隆拢  脥录1. 脢鹿脫脙DRAGON 录脝脣茫路脰脳脫脙猫脢枚路没 脳垄脪芒拢潞脛茫驴脡脪脭脭脷脮芒赂枚脢媒戮脻驴芒脰脨录矛脣梅碌掳掳脳脢脺脤氓碌脛脜盲脤氓路脰脳脫: www.guidetopharmacology.org碌脠隆拢 2) 陆芦脪漏脦茂路脰脳脫脙猫脢枚路没卤拢麓忙虏垄脙眉脙没脦陋隆掳QSARMolDes.txt隆卤 (脠莽脥录2脣霉脢戮)隆拢  脥录2. 卤拢麓忙虏垄脙眉脙没脦脛录镁脦陋隆掳QSARMolDes.txt隆卤 3) 脢鹿脫脙Excel麓貌驴陋隆掳QSARMolDes.txt隆卤脦脛录镁虏垄脡猫脰脙脧脿鹿脴虏脦脢媒拢篓脠莽脥录3脣霉脢戮拢漏隆拢  脥录3. 脭脷Excel脰脨脡猫脰脙QSAR碌脛虏脦脢媒 脛茫卤脴脨毛脭脷隆掳QSARMolDes.txt隆卤脰脨脩脧赂帽掳麓脮脮赂帽脢陆脡猫脰脙虏脦脢媒拢卢脭脷碌脷露镁脨脨碌脛碌脷脪禄赂枚脢媒脳脰脢脟脫脙脫脷QSAR录脝脣茫碌脛脜盲脤氓路脰脳脫脢媒拢禄脭脷碌脷脠媒脨脨脡脧碌脛脳脰路没隆掳on隆卤麓煤卤铆脰赂露篓脕脣脩碌脕路录炉潞脥脩茅脰陇录炉拢卢碌脷脣脛脨脨脢脟脩碌脕路录炉碌脛脨貌潞脜拢卢碌脷脦氓脨脨脢脟脩茅脰陇录炉碌脛脨貌潞脜拢卢麓脣脨貌潞脜露脭脫娄脦脛录镁隆掳QSARMolDes.txt隆卤碌脳脧脗脜盲脤氓碌脛脨貌潞脜拢篓脠莽脥录3脣霉脢戮拢漏隆拢脠莽鹿没碌脷脠媒脨脨脢脟隆卤off隆卤拢卢脭貌脢鹿脫脙脕么脪禄脩茅脰陇路篓拢篓LOO拢漏陆酶脨脨QSAR碌脛录脝脣茫拢卢脭脷脮芒脰脰脟茅驴枚脧脗拢卢碌脷脣脛隆垄脦氓脨脨碌脛脢媒脳脰驴脡脪脭脢隆脗脭拢卢MolAICal脳脭露炉脢鹿脫脙脕么脪禄路篓脰赂露篓脩碌脕路录炉脫毛脩茅脰陇录炉陆酶脨脨脭脣脣茫拢篓脟毛虏脦驴录脢戮脌媒脦脛录镁拢潞隆掳QSARMolDes_LOO.txt隆卤拢漏隆拢鲁媒麓脣脰庐脥芒拢卢脢碌脩茅脰碌脠莽pKd碌脠脫娄赂脙录脫碌陆碌脷脠媒脕脨脰脨拢篓脠莽脥录3脣霉脢戮拢漏 3.2. QSAR录脝脣茫 脭脣脨脨脠莽脧脗脙眉脕卯: 录脵脠莽脛茫脧毛脕脣陆芒赂眉露脿碌脛QSAR虏脦脢媒拢卢脟毛虏脦驴录MolAICal碌脛脣碌脙梅脢茅隆拢卤戮陆脤鲁脤陆枚陆枚掳眉脌篓10赂枚脜盲脤氓隆拢碌卤Q2碌脛脭脣脣茫脰碌脪脩戮颅脗煤脳茫脛茫碌脛脩脨戮驴脛驴碌脛拢卢脛茫驴脡脪脭脥篓鹿媒隆掳Ctrl + C隆卤驴矛陆脻录眉脰脮脰鹿MolAICal碌脛脭脣脨脨隆拢脳卯潞贸碌脛陆谩鹿没卤拢麓忙脭脷隆掳QSAROutFile.dat隆卤脦脛录镁脰脨拢卢麓貌驴陋隆掳QSAROutFile.dat隆卤拢卢脝盲戮脽脤氓脭脣脣茫陆谩鹿没碌脛脨脜脧垄脠莽脧脗拢潞  |
回复此楼» 猜你喜欢
售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急
已经有4人回复
-
售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急
已经有4人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急
已经有8人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急
已经有4人回复
-
售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急
已经有4人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急
已经有4人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急
已经有4人回复
-
售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急
已经有6人回复
-
售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急
已经有6人回复
-
售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急
已经有4人回复
