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Fieen

铁虫 (初入文坛)

[求助] 铂催化的氢化加成反应过渡态计算

我想通过gaussian 09w计算铂催化的油酸(含有一个双键的18碳脂肪酸)的氢化反应。目前已经完成结构的优化和频率分析,想对过渡态和反应能垒进行分析,但是不知道接下来该如何做,求大神指点。我该如何画gjf文件,氢 铂和油酸是一个什么样的状态?反应机理如图。 还有我在哪里可以设置反应的温度?

铂催化的氢化加成反应过渡态计算


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KaesarSang

新虫 (初入文坛)

参考手册或者教程,网上找找
2楼2020-08-13 14:58:25
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paramecium86

版主 (著名写手)

具体怎么摆这个最好查查文献。有没有人以前算过这个类似的路径。你学着画就行。如果找不到文献。那你就得自己从反应物自己判断出TS的大概结构。或者通过路径这种平面图 用你的“化学直觉”这种有些玄学的玩意自己判断一下可能的结构。当然可以通过柔性扫描之类的方法帮你“猜”出过渡态的结构。  比较通用的做反应路径的方法可以参考我这个教程的 1.10节 https://muchong.com/t-14242735-1    论坛里也各种讨论过过渡态的问题。可以搜搜。
3楼2020-08-13 15:37:15
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Fieen

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by paramecium86 at 2020-08-13 15:37:15
具体怎么摆这个最好查查文献。有没有人以前算过这个类似的路径。你学着画就行。如果找不到文献。那你就得自己从反应物自己判断出TS的大概结构。或者通过路径这种平面图 用你的“化学直觉”这种有些玄学的玩意自己判 ...

多谢指教!

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4楼2020-08-13 16:40:24
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Fieen

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by KaesarSang at 2020-08-13 14:58:25
参考手册或者教程,网上找找

好的,谢谢哦

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5楼2020-08-13 16:40:45
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