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[交流] WGCNA四分文章套路视频(TCGA和GEO数据库联合共表达分析)

WGCNA四分文章套路视频(TCGA和GEO数据库联合共表达分析)
                                                                                         --生信自学网
        今天我们讲解下TCGA和GEO数据库分别构建WGCNA网络的文章套路,这个课程是根据最新的文献(Identification of Hub Genes Associated With Development of Head and Neck Squamous Cell Carcinoma by Integrated Bioinformatics Analysis)录制。文中同时展示两个WGCNA网络,是非常新颖的文章套路。
        WGCNA四分文章套路视频内容包括:WGCNA文章套路简介,软件准备,转录组数据下载,转录组数据整理,转录组id转换,临床数据下载,临床信息提取,GEO数据下载,GEO数据注释,TCGA差异分析,TCGA数据库WGCNA分析,GEO差异分析,GEO数据库WGCNA分析,差异分析和WGCNA交集,symbol转换为id,GO富集分析,KEGG富集分析,PPI网络构建,网络核心基因,生存分析输入文件准备,生存分析(OS),DFS分析,临床相关性,HPA数据库。

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