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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 分子动力学模拟中的相互作用能
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ty_唐

木虫 (正式写手)

[求助] 分子动力学模拟中的相互作用能

为什么我跑完动力学算出来的相互作用能量达到了几万KJ/mol，最低的时候也有七八千……求各位大神指导下，能量在多少范围内是合理的？
（计算公式：E总-Ea-Eb）
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1楼 2020-08-05 16:07:25
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寻道上高楼

新虫 (小有名气)
不是得吉布斯自由能小于0，才能自发结合吗

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2楼2020-08-05 16:12:54
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ty_唐

木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 寻道上高楼 at 2020-08-05 16:12:54
不是得吉布斯自由能小于0，才能自发结合吗

不好意思，忘了说是负的，但是负的很大。文献中看到的大多只有负的几百KJ/mol
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3楼2020-08-05 16:16:44
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寻道上高楼

新虫 (小有名气)
一般认为配体与受体结合的构象稳定时能量越低，发生的作用可能性越大，结合能≤?5.0 kJ/mol
作为筛选标准。

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4楼2020-08-05 16:19:05
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