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luqing6879木虫 (著名写手)
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dlpoly 计算报错已有1人参与
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大家好，我用packmol 生成一个20*20*20的盒子，包含265个水分子。然后我用dlpoly-java-gui 读取这个盒子的.xyz文件，并将得到的CFGEDT.0转存成CONFIG文件。 之后我用dlpoly-java-gui生成OPLS FIELD.下面是我的CONTROL文件： water in box temperature 300.0 pressure 0.001 steps 2000 equilibration 500 timestep 0.005 multiple 1 print 10 stats 10 scale 10 restart scale rdf 10 print rdf cutoff 7.0 rvdw 7.0 delr 1.0 ewald precision 1.e-6 ensemble nvt hoover 1.0 job time 36000 close time 100 traj finish 但是用以上文件运行dlpoly得到以下报错信息： At line 231 of file /home/package/dl_poly_4.09/source/read_config_parallel.f90 (unit = 11, file = 'CONFIG') Fortran runtime error: End of file Error termination. Backtrace: #0 0x7fdec69a72ed in ??? #1 0x7fdec69a7ed5 in ??? #2 0x7fdec69a869d in ??? #3 0x7fdec6b1eca3 in ??? #4 0x7fdec6b1f28a in ??? #5 0x7fdec6b1be8f in ??? #6 0x7fdec6b2079c in ??? #7 0x7fdec6b2172c in ??? #8 0x7fdec6b1e894 in ??? #9 0x55dfdbc89cf3 in ??? #10 0x55dfdbc85fe2 in ??? #11 0x55dfdbb723ee in ??? #12 0x55dfdba8ff8f in ??? #13 0x55dfdba874ee in ??? #14 0x7fdec6006b96 in ??? #15 0x55dfdba87529 in ??? #16 0xffffffffffffffff in ??? 而OUTPUT文件结尾部分显示： I/O write method: parallel by using MPI-I/O (assumed) I/O write type: data sorting on (assumed) I/O writers (assumed) 1 I/O write batch size (assumed) 2000000 I/O write buffer size (assumed) 20000 I/O parallel write error checking off (assumed) *** warning - DD cutoff check: rcut=Max(rcut,rvdw,rmet,rkim,rcbnd,2.0_wp*rcter+1.0e-6_wp) ! *** warning issued 40 *** warning - tentative cutoff reset to 7.000 Angstroms !!! *** node/domain decomposition (x,y,z): 1 1 1 pure cutoff driven limit on largest possible decomposition: 27 nodes/domains (3,3,3) pure cutoff driven limit on largest balanced decomposition: 1 nodes/domains (1,1,1) cutoffs driven limit on largest possible decomposition: 27 nodes/domains (3,3,3) cutoffs driven limit on largest balanced decomposition: 1 nodes/domains (1,1,1) link-cell decomposition 1 (x,y,z): 3 3 3 请问是哪里除了问题了呢？ 谢谢大家的帮助 |
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