24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 1900  |  回复: 2
【悬赏金币】回答本帖问题,作者yyy0305将赠送您 100 个金币

yyy0305

至尊木虫 (著名写手)

[求助] 转录因子结合位点实验验证设计思路

从现有的文献资料数据库得到的转录因子的核苷酸结合位点的motif,怎么设计一段核苷酸序列放在Minimal promoter前面验证其启动结合活性?

我现在掌握的一些资料只允许我进行模仿,但没有独立思考的能力,分享出来和大家讨论下

我从Promega的官网上找到了NF-KB转录因子信号通路的设计,设计包括由一段转录因子结合位点和一个Minimal promoter的连续核苷酸序列,后面接一个luciferase的基因,如下:
GGGAATTTCC GGGGACTTTCC GGGAATTTCC GGGGACTTTCC GGGAATTTCC
两个不同NF-KB motif的重复组合

AGATCTGGCCTCGGCGGCCAAGCTTAGACACTA
不知道这段的作用是什么?

GAGGGTATATAATGGAAGCTCGACTTCCAG
Minimal promotor

请问一下在设计类似的转录因子结合位点时,一般设计的原则是什么?如转录因子结合位点的motif如何进行重复和穿插设计,在结合位点和Minimal Promtor的核苷酸之间是否需要添加一段的核苷酸序列,这段序列的作用是什么?@biostar2009@wizardfan
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
2楼2020-07-28 13:34:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

匿名

本帖仅楼主可见
3楼2021-05-04 20:51:50
已阅   申请MolEPI   回复此楼   编辑   查看我的主页
相关版块跳转 我要订阅楼主 yyy0305 的主题更新
不应助 确定回帖应助 (注意:应助才可能被奖励,但不允许灌水,必须填写15个字符以上)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 评审有感 +4 popular289 2026-05-18 9/450 2026-05-18 21:31 by popular289
[基金申请] 面上本子正文33页,违规吗?会被低分嘛? +8 1234567wang 2026-05-17 10/500 2026-05-18 18:52 by zzahkj
[基金申请] 国自然上会要求 +5 无名者登山 2026-05-18 9/450 2026-05-18 17:50 by BlakeReary
[考博] 博士申请 +4 星…… 2026-05-18 5/250 2026-05-18 17:34 by 炎甲00
[硕博家园] 考博自荐 +5 科研狗111 2026-05-13 6/300 2026-05-18 11:22 by 糊糊涂涂好
[基金申请] 重磅!青年科学基金项目(C类)资助增幅预计超过50% +7 水和泥不是水泥 2026-05-13 10/500 2026-05-18 07:50 by 水和泥不是水泥
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 ky2p12rrjj 2026-05-15 4/200 2026-05-17 19:47 by Equinoxhua
[考博] 2026博士还有哪些学校有名额 +6 小王求读研 2026-05-15 7/350 2026-05-17 16:54 by 知音湖畔
[考博] 光量子物理方向 博士招生 1人(2026.09) +3 sandyworld 2026-05-15 4/200 2026-05-17 14:38 by sandyworld
[基金申请] 这年头没有找到涵评专家,还有中面上的可能吗 +13 dd921ww 2026-05-12 16/800 2026-05-17 12:38 by 于轩
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 v9tggjlwd0 2026-05-15 4/200 2026-05-17 08:11 by 11n4dfd8yn
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 v9tggjlwd0 2026-05-15 4/200 2026-05-17 08:06 by 11n4dfd8yn
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 l7k6xnh0yc 2026-05-14 6/300 2026-05-17 07:31 by 11n4dfd8yn
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 l7k6xnh0yc 2026-05-14 8/400 2026-05-17 07:26 by 11n4dfd8yn
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 k37jurhrau 2026-05-16 3/150 2026-05-17 01:37 by ue3ir18jc3
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 ky2p12rrjj 2026-05-15 3/150 2026-05-17 00:45 by ue3ir18jc3
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 x0mp7owy2b 2026-05-15 4/200 2026-05-17 00:25 by ue3ir18jc3
[高分子] 本人最近太闲了,谁有问题可以提,每天会统一回复 +9 一切都是空工 2026-05-12 20/1000 2026-05-16 19:52 by Equinoxhua
[有机交流] 求有机合成大神指点三硫酸乙烯酯(CAS:2793408-99-6)的合成路线 30+3 Leekmid 2026-05-13 10/500 2026-05-16 16:37 by czyzsu
[硕博家园] 申请博士 +3 呃?呃 2026-05-15 3/150 2026-05-16 11:01 by a4742549
信息提示
请填处理意见