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[交流] wb实验常见诊断报告和优化方案 已有1人参与

实验案例1:泳道高背景
问题分析:多条带以及高背景集中在泳道上,大概率是样本时间太久,或者蛋白酶抑制剂没加发生了蛋白降解,或者是组织样本中,成分太复杂,加上抗体特异性一般造成的。
        wb实验常见诊断报告和优化方案
问题诊断
1. 样本时间太久
2. 组织样本背景高
3. 蛋白酶抑制剂/磷酸酶抑制剂没有加
建议方案
新鲜制备样本,加入蛋白酶抑制剂。对于组织样本,要求超声。对于特异性一般的抗体,先用细胞样本做下。
  
实验案例2:全膜高背景
问题分析:像这种全膜的高背景,大概率是缓冲液的问题。可以提高封闭液浓度和封闭时间,抗体稀释液使用5%脱脂牛奶或者根据说明书要求来,洗涤的TBST增加nacl浓度以及吐温浓度,增加洗涤的次数和时间。
        wb实验常见诊断报告和优化方案-1
问题诊断
1. 封闭液
2. 抗体稀释液
3. 洗涤
建议方案
封闭液使用5%脱脂牛奶(新鲜配置),4度封闭过夜。抗体稀释液使用5%脱脂牛奶,TBST中nacl浓度增加至500mM,吐温增加至0.5%,洗涤15min*3次或者10min*4次。
PS:这个case客户本来使用1%BSA稀释抗体,换用5%BSA,背景就没问题了
  
实验案例3:全膜高背景
问题分析:排除二抗非特异性,就是不加一抗,直接加二抗孵育,看是否有非特异性条带,对于一般客户来说,更换二抗是更加简便的方法。(能拿结果,不仅仅验证),二抗稀释液强烈推荐5%脱脂牛奶,如果前两者都无法改善结果,考虑一抗非特异性。
        wb实验常见诊断报告和优化方案-2
问题诊断
1. 二抗非特异性
2. 抗体稀释液
3. 一抗非特异性
建议方案
更换二抗,排除二抗非特异西,二抗稀释液使用5%脱脂牛奶,更换一抗。
更换二抗后【如左图】
  
实验案例4:高背景、杂带
问题分析:全膜的背景问题,主要是一抗二抗未洗涤干净,基本残留在膜上。
        wb实验常见诊断报告和优化方案-3
问题诊断
1. 洗涤不充分
建议方案
TBST中nacl浓度增加至500mM,吐温增加至0.5%,洗涤15min*3次或者10min*4次
优化后结果【如左图】
  
实验案例5:条带过粗、杂带
问题分析:条带过于粗往往是因为样本上样量太高,一抗浓度高,加上曝光时间久。
        wb实验常见诊断报告和优化方案-4
问题诊断
1. 样本信号太强
2. 杂带多
3. 曝光时间太久
建议方案
减少上样量,减少一抗浓度,减少曝光时间。
优化后结果【如左图】
  
实验案例6:不出带
问题分析:一般没条带的主要关注样本表达量,文献或者看上下游蛋白结果,如果是磷酸化的,还要看上下游的磷酸化。对于大分子量(150KD以上)或者小分子蛋白(小于20KD),看下丽春红染色,确认转膜效率。抗体浓度和曝光时间帮助增强信号。
        wb实验常见诊断报告和优化方案-5
问题诊断
1. 样本表达量和处理方式
2. 转膜
3. 抗体浓度
4. 曝光时间
建议方案
增加上样量,使用合适的刺激处理方式,增加阳性
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02192151

新虫 (著名写手)


2楼2020-08-14 08:42:04
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