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番茄龙利鱼

银虫 (正式写手)

[交流] MS用Adsorption Locator模块做分子吸附时怎么考虑水溶剂影响?

之前用Adsorption Locator都是在真空条件下,加载一个分子吸附在金属表面,如图1,最近看文献发现也能做考虑水溶剂影响下的吸附(图2),网上关于adsorption locator的操作教程比较少,

于是自己试了一下,如果在Adsorption Locator calculation 里 Adsorbate同时加载该分子和50个溶剂水分子,最后出来的吸附能是该分子和50水分子的总和呀 特别大,想来这样操作应该不对?我只想得到在水溶剂影响下该分子的吸附能

请问虫友们H2O分子是如何加进去的?

MS用Adsorption Locator模块做分子吸附时怎么考虑水溶剂影响?
图1.jpg


MS用Adsorption Locator模块做分子吸附时怎么考虑水溶剂影响?-1
图2.jpg
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