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蓝蝶梦

新虫 (小有名气)

[求助] Gaussian适合算高分子PTFE和氢离子的吸附情形吗 已有1人参与

我想得到PTFE分子表面吸附一个氢离子的静电势能图。我用Gaussian试了一下。
1. 如果优化前,在atom groups里把H的charge设置为1。然后,DFT优化之后,再点开atom groups看,H的charge又自动变成0了。
2. 如果优化前,在优化设置界面把整体的charge设置为1,然后DFT优化。优化结果和上一条的结果一模一样。

我的问题是:
1. 用Gaussian做这件事是否合理?应该换哪种软件?
2. 如果可以用Gaussian做,那又如何让H是离子而不是原子?

谢谢!
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paramecium86

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【答案】应助回帖

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zhou2009: 金币+5 2020-07-10 14:07:48
高斯是量化计算,把高分子和H离子看作一个整体。你只能设定整个体系的电荷量。至于这个电荷具体在哪里,那得计算完成后查看电荷的分布。不存在某个电荷定域在某一个原子上的情形。电荷都是离域的 分散在整个分子上的不是。只是有的地方多有的地方少而已。不能人为的吧电荷加在某一个地方的。 用高斯去计算,就设置好整个体系的电荷,算完之后直接做静电势的图就可以了。不过高斯这种计算真空中孤立体系的量化计算软件并不适合做高分子的计算。可以试试用dmol3之类的可以计算周期性体系的软件去算静电势的

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2楼2020-07-10 10:15:27
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蓝蝶梦

新虫 (小有名气)

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引用回帖:
2楼: Originally posted by paramecium86 at 2020-07-10 10:15:27
高斯是量化计算,把高分子和H离子看作一个整体。你只能设定整个体系的电荷量。至于这个电荷具体在哪里,那得计算完成后查看电荷的分布。不存在某个电荷定域在某一个原子上的情形。电荷都是离域的 分散在整个分子上的 ...

谢谢!

发自小木虫Android客户端
3楼2021-03-01 20:10:30
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