24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
查看: 1630  |  回复: 3
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

aaq2800

铁杆木虫 (知名作家)

[求助] 求助------Error termination in NtrErr 错误已有1人参与

本人对gaussian不熟悉,偶尔会用一下。
出现error termination in ntrerr: ntrerr called from fileio,自己琢磨好几天了,在网上搜了同类错误。有说是版本bug的,用windows版的高斯b, c, d三个版本测试,都是这样。有说空间不够的,但用单一基组的测试没任何问题,换基组测试也不行。换了几台机器,都是显示这样的错误。这好几天时间全耗在这个上面了,谢谢各位大侠了!!!    大侠看看输入文件可对?

输入文件如下:
%chk=7ringb1d.chk
%mem=128mb
%nproc=1
#pbe1pbe/gen scf=(maxcyc=200,xqc)

7ringb1d

-2 1   
b             5.611418            1.933797            0.376608
b             3.900319            2.459868            0.195193
b             5.115092           -0.901211            0.159315
b             0.080223           -0.088489           -0.059474
b             3.965872            4.280743            0.234774
b             1.190410           -2.699910           -0.346188
b             1.126931            4.420126            0.350967
b             0.611581            2.923667            0.190534
b             5.300782            3.464329            0.213984
b             2.396574            3.317006            0.299670
b             5.950261            0.390480            0.566658
b             1.621448           -1.078498           -0.085864
b             0.031006            1.476387            0.031544
rh            2.204324            1.085763            0.114876
b             4.351614            0.710288            0.045432
b             0.051553           -1.672935           -0.201573
b             3.330649           -0.775687           -0.069755
b             4.300976           -2.188238           -0.225817
b             2.548675            5.007577            0.351019
b             2.771094           -2.488217           -0.343222



b
6-311g(d)
****
rh
def2tzvp
****

rh  0
def2tzvp

输出文件如下:
gaussian 09:  ia32w-g09revc.01 23-sep-2011
                08-jul-2020
******************************************
%chk=7ringb1d.chk
%mem=128mb
%nproc=1
will use up to    1 processors via shared memory.
---------------------------------
#pbe1pbe/gen scf=(maxcyc=200,xqc)
---------------------------------
1/38=1/1;
2/12=2,17=6,18=5,40=1/2;
3/5=7,11=2,16=1,25=1,30=1,74=-13/1,2,3;
4//1;
5/5=2,7=200,8=3,13=1,38=5/2,8;
6/7=2,8=2,9=2,10=2,28=1/1;
99/5=1,9=1/99;
leave link    1 at wed jul 08 13:19:15 2020, maxmem=   16777216 cpu:       0.0
(enter c:\g09w\l101.exe)
--------
7ringb1d
--------
charge = -2 multiplicity = 1
symbolic z-matrix:
b                     5.61142   1.9338    0.37661
b                     3.90032   2.45987   0.19519
b                     5.11509  -0.90121   0.15932
b                     0.08022  -0.08849  -0.05947
b                     3.96587   4.28074   0.23477
b                     1.19041  -2.69991  -0.34619
b                     1.12693   4.42013   0.35097
b                     0.61158   2.92367   0.19053
b                     5.30078   3.46433   0.21398
b                     2.39657   3.31701   0.29967
b                     5.95026   0.39048   0.56666
b                     1.62145  -1.0785   -0.08586
b                     0.03101   1.47639   0.03154
rh                    2.20432   1.08576   0.11488
b                     4.35161   0.71029   0.04543
b                     0.05155  -1.67294  -0.20157
b                     3.33065  -0.77569  -0.06976
b                     4.30098  -2.18824  -0.22582
b                     2.54868   5.00758   0.35102
b                     2.77109  -2.48822  -0.34322

natoms=     20 nqm=        0 nqmf=       0 nmmi=     20 nmmif=      0
                nmic=       0 nmicf=      0.
                    isotopes and nuclear properties:
(nuclear quadrupole moments (nqmom) in fm**2, nuclear magnetic moments (nmagm)
  in nuclear magnetons)

  atom         1           2           3           4           5           6           7           8           9          10
iatwgt=          11          11          11          11          11          11          11          11          11          11
atmwgt=  11.0093053  11.0093053  11.0093053  11.0093053  11.0093053  11.0093053  11.0093053  11.0093053  11.0093053  11.0093053
nucspn=           3           3           3           3           3           3           3           3           3           3
atzeff=   0.0000000   0.0000000   0.0000000   0.0000000   0.0000000   0.0000000   0.0000000   0.0000000   0.0000000   0.0000000
nqmom=    4.0590000   4.0590000   4.0590000   4.0590000   4.0590000   4.0590000   4.0590000   4.0590000   4.0590000   4.0590000
nmagm=    2.6886370   2.6886370   2.6886370   2.6886370   2.6886370   2.6886370   2.6886370   2.6886370   2.6886370   2.6886370

  atom        11          12          13          14          15          16          17          18          19          20
iatwgt=          11          11          11         103          11          11          11          11          11          11
atmwgt=  11.0093053  11.0093053  11.0093053 102.9048000  11.0093053  11.0093053  11.0093053  11.0093053  11.0093053  11.0093053
nucspn=           3           3           3           1           3           3           3           3           3           3
atzeff=   0.0000000   0.0000000   0.0000000   0.0000000   0.0000000   0.0000000   0.0000000   0.0000000   0.0000000   0.0000000
nqmom=    4.0590000   4.0590000   4.0590000   0.0000000   4.0590000   4.0590000   4.0590000   4.0590000   4.0590000   4.0590000
nmagm=    2.6886370   2.6886370   2.6886370  -0.0884000   2.6886370   2.6886370   2.6886370   2.6886370   2.6886370   2.6886370
leave link  101 at wed jul 08 13:19:15 2020, maxmem=   16777216 cpu:       0.0
(enter c:\g09w\l202.exe)
                          input orientation:                          
---------------------------------------------------------------------
center     atomic      atomic             coordinates (angstroms)
number     number       type             x           y           z
---------------------------------------------------------------------
      1          5           0        5.611418    1.933797    0.376608
      2          5           0        3.900319    2.459868    0.195193
      3          5           0        5.115092   -0.901211    0.159315
      4          5           0        0.080223   -0.088489   -0.059474
      5          5           0        3.965872    4.280743    0.234774
      6          5           0        1.190410   -2.699910   -0.346188
      7          5           0        1.126931    4.420126    0.350967
      8          5           0        0.611581    2.923667    0.190534
      9          5           0        5.300782    3.464329    0.213984
     10          5           0        2.396574    3.317006    0.299670
     11          5           0        5.950261    0.390480    0.566658
     12          5           0        1.621448   -1.078498   -0.085864
     13          5           0        0.031006    1.476387    0.031544
     14         45           0        2.204324    1.085763    0.114876
     15          5           0        4.351614    0.710288    0.045432
     16          5           0        0.051553   -1.672935   -0.201573
     17          5           0        3.330649   -0.775687   -0.069755
     18          5           0        4.300976   -2.188238   -0.225817
     19          5           0        2.548675    5.007577    0.351019
     20          5           0        2.771094   -2.488217   -0.343222
---------------------------------------------------------------------
                    distance matrix (angstroms):
                    1          2          3          4          5
     1  b    0.000000
     2  b    1.799312   0.000000
     3  b    2.886317   3.574047   0.000000
     4  b    5.905415   4.599143   5.104732   0.000000
     5  b    2.869860   1.822484   5.308394   5.854489   0.000000
     6  b    6.445075   5.853205   4.346721   2.852059   7.534602
     7  b    5.127681   3.399788   6.652728   4.646684   2.844735
     8  b    5.100278   3.321284   5.908661   3.068864   3.618685
     9  b    1.570181   1.723540   4.369829   6.320722   1.564912
    10  b    3.500630   1.734027   5.020298   4.134231   1.842742
    11  b    1.591465   2.936429   1.591195   5.922736   4.379737
    12  b    5.020723   4.218090   3.506721   1.831990   5.858378
    13  b    5.609750   3.995698   5.614021   1.568293   4.836206
    14  rh   3.520789   2.184265   3.524572   2.433325   3.650387
    15  b    1.787109   1.813043   1.786840   4.346703   3.596220
    16  b    6.652436   5.661315   5.134708   1.591064   7.138527
    17  b    3.569657   3.295988   1.803459   3.322291   5.105265
    18  b    4.367075   4.684300   1.570844   4.717136   6.494009
    19  b    4.339259   2.888260   6.444922   5.677292   1.596950
    20  b    5.304696   5.103781   2.874971   3.616627   6.897854
                    6          7          8          9         10
     6  b    0.000000
     7  b    7.154367   0.000000
     8  b    5.678709   1.590822   0.000000
     9  b    7.430127   4.284080   4.720325   0.000000
    10  b    6.170514   1.682706   1.831072   2.909204   0.000000
    11  b    5.748041   6.288806   5.921149   3.161447   4.611348
    12  b    1.697804   5.538071   4.136853   5.853604   4.479946
    13  b    4.350673   3.157322   1.567471   5.635223   3.009266
    14  rh   3.946127   3.512049   2.433197   3.905823   2.247121
    15  b    4.666479   4.924919   4.348327   2.917888   3.268302
    16  b    1.540320   6.211854   4.647164   7.356533   5.536233
    17  b    2.891310   5.659492   4.598511   4.683980   4.214156
    18  b    3.154666   7.353755   6.317955   5.757130   5.848982
    19  b    7.857247   1.538329   2.849696   3.158241   1.698176
    20  b    1.594799   7.135151   5.851229   6.491733   5.852708
                   11         12         13         14         15
    11  b    0.000000
    12  b    4.617608   0.000000
    13  b    6.041781   3.011765   0.000000
    14  rh   3.836609   2.250348   2.209715   0.000000
    15  b    1.711615   3.266619   4.388024   2.180976   0.000000
    16  b    6.296238   1.682651   3.158005   3.513542   4.922529
    17  b    2.937232   1.735892   3.996216   2.183505   1.806588
    18  b    3.161953   2.903615   5.632793   3.902705   2.911631
    19  b    5.738891   6.171785   4.348566   3.943978   4.670189
    20  b    4.384277   1.837179   4.833903   3.647522   3.588806
                   16         17         18         19         20
    16  b    0.000000
    17  b    3.402191   0.000000
    18  b    4.280622   1.720811   0.000000
    19  b    7.153336   5.851041   7.428530   0.000000
    20  b    2.842649   1.822264   1.563429   7.531160   0.000000
stoichiometry    b19rh(2-)
framework group  c1[x(b19rh)]
deg. of freedom    54
full point group                 c1      nop   1
largest abelian subgroup         c1      nop   1
largest concise abelian subgroup c1      nop   1
                         standard orientation:                        
---------------------------------------------------------------------
center     atomic      atomic             coordinates (angstroms)
number     number       type             x           y           z
---------------------------------------------------------------------
      1          5           0       -1.445530    2.762181    0.074889
      2          5           0       -1.649225    0.980400   -0.071001
      3          5           0        1.440657    2.768314    0.101643
      4          5           0        1.536028   -2.335195    0.043473
      5          5           0       -3.450542    0.724339   -0.176540
      6          5           0        3.929746   -0.790143   -0.087557
      7          5           0       -3.104158   -2.089791    0.054130
      8          5           0       -1.532821   -2.337185    0.033930
      9          5           0       -2.879545    2.181270   -0.192716
     10          5           0       -2.237940   -0.647324    0.032830
     11          5           0       -0.006189    3.373923    0.369557
     12          5           0        2.242000   -0.644784    0.026119
     13          5           0        0.001468   -2.657395    0.014221
     14         45           0        0.000300   -0.447746    0.031372
     15          5           0        0.001711    1.729045   -0.103665
     16          5           0        3.107635   -2.087693    0.026828
     17          5           0        1.646733    0.983724   -0.057211
     18          5           0        2.877391    2.183259   -0.145447
     19          5           0       -3.927431   -0.794862   -0.054659
     20          5           0        3.447309    0.727634   -0.171173
---------------------------------------------------------------------
rotational constants (ghz):      0.6274607      0.3985420      0.2445598
leave link  202 at wed jul 08 13:19:15 2020, maxmem=   16777216 cpu:       0.0
(enter c:\g09w\l301.exe)
general basis read from cards:  (5d, 7f)
warning:  center   1 has no basis functions!
warning:  center   2 has no basis functions!
warning:  center   3 has no basis functions!
warning:  center   4 has no basis functions!
warning:  center   5 has no basis functions!
warning:  center   6 has no basis functions!
warning:  center   7 has no basis functions!
warning:  center   8 has no basis functions!
warning:  center   9 has no basis functions!
warning:  center  10 has no basis functions!
warning:  center  11 has no basis functions!
warning:  center  12 has no basis functions!
warning:  center  13 has no basis functions!
warning:  center  14 has no basis functions!
warning:  center  15 has no basis functions!
warning:  center  16 has no basis functions!
warning:  center  17 has no basis functions!
warning:  center  18 has no basis functions!
warning:  center  19 has no basis functions!
warning:  center  20 has no basis functions!
ernie: thresh=  0.10000d-02 tol=  0.10000d-05 strict=f.
bad length for file.
fileio: ioper= 1 ifilno(1)=  -582 len=           0 ipos=           0 q=        112787576


dumping /fiocom/, unit = 1 nfiles =    28 sizext =    524288 winblk =       512
                   defal = t lstwrd =      622080 ftype=2 fmxfil=10000

number           0        501        502        503        507        521        551        552
base        108544      23552      41472      96256      96768     106496     104448     103424
end         622080      24552      43525      96507      96943     106531     104473     103438
end1        622080      24576      44032      96768      97280     107008     104960     103936
wr pntr     106496      23552      43525      96256      96768     106531     104448     103424
rd pntr     106496      24552      41472      96256      96768     106496     104473     103424
length      513536       1000       2053        251        175         35         25         14

number         559        561        562        579        583        598        670        674
base        107520     104960      97792     103936     108032      44032     107008      97280
end         107521     104961     103355     103946     108043      44035     107024      97436
end1        108032     105472     103424     104448     108544      44544     107520      97792
wr pntr     107521     104960      97792     103936     108043      44032     107024      97280
rd pntr     107520     104960     103355     103936     108032      44032     107008      97280
length           1          1       5563         10         11          3         16        156

number         698        761        989        991        992        993        994        995
base        105984     105472      24576      37888      37376      23040      20480      22528
end         106104     105473      37076      41169      37381      23140      20510      22538
end1        106496     105984      37376      41472      37888      23552      20992      23040
wr pntr     105984     105472      24576      37888      37376      23040      20480      22528
rd pntr     105984     105472      24576      41169      37381      23140      20510      22538
length         120          1      12500       3281          5        100         30         10

number         996        997        998        999
base         21504      22016      20992      44544
end          21604      22341      21192      95796
end1         22016      22528      21504      96256
wr pntr      21504      22016      20992      44544
rd pntr      21604      22329      21192      45796
length         100        325        200      51252


dumping /fiocom/, unit = 2 nfiles =     1 sizext =         0 winblk =       512
                   defal = f lstwrd =       67072 ftype=2 fmxfil=10000

number           0
base         20480
end          67072
end1         67072
wr pntr      20480
rd pntr      20480
length       46592


dumping /fiocom/, unit = 3 nfiles =     1 sizext =    524288 winblk =       512
                   defal = t lstwrd =       67072 ftype=2 fmxfil=10000

number           0
base         20480
end          67072
end1         67072
wr pntr      20480
rd pntr      20480
length       46592
error termination in ntrerr:
ntrerr called from fileio.
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
3楼2020-07-08 23:37:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 4 个回答

paramecium86

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
aaq2800: 金币+50, ★★★★★最佳答案 2020-07-09 09:08:26
错误不是最后 而是在中间出现的一大段
warning:  center   1 has no basis functions!
warning:  center   2 has no basis functions!
warning:  center   3 has no basis functions!
warning:  center   4 has no basis functions!
warning:  center   5 has no basis functions!
warning:  center   6 has no basis functions!
warning:  center   7 has no basis functions!
warning:  center   8 has no basis functions!
warning:  center   9 has no basis functions!
warning:  center  10 has no basis functions!
warning:  center  11 has no basis functions!
warning:  center  12 has no basis functions!
warning:  center  13 has no basis functions!
warning:  center  14 has no basis functions!
warning:  center  15 has no basis functions!
warning:  center  16 has no basis functions!
warning:  center  17 has no basis functions!
warning:  center  18 has no basis functions!
warning:  center  19 has no basis functions!
warning:  center  20 has no basis functions!

这个提示很明显就是说 高斯没有找到基组。再回到你的输入文件 你最后的基组和分子结构之间只能空一行 而你的输入文件空了两行 格式不对。高斯就读不到基组了。
2楼2020-07-08 22:41:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

aaq2800

铁杆木虫 (知名作家)

引用回帖:
2楼: Originally posted by paramecium86 at 2020-07-08 22:41:46
错误不是最后 而是在中间出现的一大段
warning:  center   1 has no basis functions!
warning:  center   2 has no basis functions!
warning:  center   3 has no basis functions!
warning:  center   4 has ...

果然是这个问题,昨天试了其他的结构,都能正常跑,以为是结构的问题。今天听你一句话,再去检查,才发现能正常跑的,的确是只空了一行。修改一下,果然正常跑了。听您一习言,胜读好几天书啊
4楼2020-07-09 09:08:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
信息提示
请填处理意见