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112976553

金虫 (小有名气)

[交流] 引物的问题

实验室在做west-blotting,做的是PSD-93蛋白,我想做一下RT-PCR,看一下它的基因表达变化。但PSD-93有好几个变异剪切体。所以引物设计就无从下手了。从文献上查了一下对大鼠PSD-93基因表达信息:
pSD一   93GeriBankaceessionnumber:U50717,mRNA全长2490bp;
正向引物GAAGTTACACACGAAGAGGCTGT
反向引物TCTCCACCCACAATGTTGAA
但发现有一个碱基突变。
看了一下蛋白质定位的基因是:DLG2(HUMAN)mapping to 11q21;DLGH2(mouse)mapping to 11D.
用以上的引物在这里面找不到定位。我想做两者关联的实验,不知道上面的引物能不能用。
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whygiveup

金虫 (著名写手)


112976553(金币+1):谢谢参与
我也想知道,来学习学习咯
坚持不懈,无怨无悔
4楼2009-07-14 16:53:40
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)


112976553(金币+1):谢谢参与
虽然是差异剪接,但是也有共同的部分,如果你想看总量,就研究共同部分
2楼2009-07-14 16:28:16
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112976553

金虫 (小有名气)

大鼠的引物在蛋白质所写的基因定位找不到位点,可不可以用啊?
这样做,基因与蛋白的关联性能不能用啊
3楼2009-07-14 16:32:10
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hyf9901

铁杆木虫 (著名写手)


112976553(金币+1):谢谢参与
既然PSD-93有好几个变异剪切体,那就针对每个不同的变异剪切体分别设计特异性引物,看看哪个是对的,或者只设计它们共有的区段,呵呵
滴自己的汗,吃自己的饭,自己的事情自己办,不抱怨,不诉苦,走一步,是一步,一路朝前不回头,死到哪站算哪站
5楼2009-07-14 16:54:32
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