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Naomi2019

新虫 (初入文坛)

[求助] RNA-seq分析思路求指导

我的RNA样本为大肠杆菌瞬时转染腺病毒的转录本。

分别为QC_OE、QC_KO、Aβ_OE、QC-Aβ_OE。

现在得到了华大基因测序的多组学系统的分析结果。

问题是,我想分析QC_OE之后显著差异表达基因和pathway,所以开始尝试用VENN图来分析,但发现我知道选择哪几组进行对比。我的理解是:比如WT vs QC↑ ∩ WT vs Aβ↑ ∩ WT vs QC-Aβ↑ ∩ Aβ↑ vs QC-Aβ↑代表 与QC↑有关的显著差异基因。

我的思路是对的吗?如果不对,我应该怎么分析呢?请大神指教。

@biostar2009 @wizardfan 发自小木虫Android客户端
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