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RNA-seq分析思路求指导
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我的RNA样本为大肠杆菌瞬时转染腺病毒的转录本。 分别为QC_OE、QC_KO、Aβ_OE、QC-Aβ_OE。 现在得到了华大基因测序的多组学系统的分析结果。 问题是，我想分析QC_OE之后显著差异表达基因和pathway，所以开始尝试用VENN图来分析，但发现我知道选择哪几组进行对比。我的理解是：比如WT vs QC↑ ∩ WT vs Aβ↑ ∩ WT vs QC-Aβ↑ ∩ Aβ↑ vs QC-Aβ↑代表 与QC↑有关的显著差异基因。 我的思路是对的吗？如果不对，我应该怎么分析呢？请大神指教。 @biostar2009 @wizardfan 发自小木虫Android客户端 |
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