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请问plumed这样的报错到底是哪里出现了问题呢?
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我在两个计算平台上提交计算作业,安装的qe和plumed版本相同,所有的input中的参数质变换了温度,但是其中一个计算平台上报错如下,另一个计算平台上则能够正常运行,百思不得其解求大佬指点一二。 报错如下: PLUMED: ################################################################################ PLUMED: PLUMED: PLUMED: +++ PLUMED error PLUMED: +++ at Action.cpp:242, function void PLMD::Action::error(const string& constPLUMED: +++ message follows +++ PLUMED: ERROR in input to action COM with label COMhe : You are trying to compute a CENTER or COM but ma sses are not known.PLUMED: If you are using plumed driver, please use the --mc option PLUMED: PLUMED: ################################################################################ 这里因为我的plumed.dat文件如下: UNITS LENGTH=A ENERGY=1312.7501 TIME=fs COMhe: COM ATOMS=1-64 COMh: COM ATOMS=65-192 dhe: DISTANCES GROUPA=COMhe GROUPB=1-64 MEAN dh: DISTANCES GROUPA=COMh GROUPB=65-192 MEAN METAD ... ARG=dhe.mean,dh.mean SIGMA=0.5,0.5 HEIGHT=1.0 PACE=5 GRID_MIN=0,0 GRID_MAX=6,6 GRID_SPACING=0.1,0.1 BIASFACTOR=10.0 TEMP=4000.0 LABEL=metad ... METAD PRINT ARG=dhe.mean,dh.mean,metad.* STRIDE=10 即我选取了两种原子的质心和各个原子距离的平均值作为CVs。 看报错的意思是我没有给出原子质量,但我在qe的input里面有标明原子的质量和赝势啊,而且我不是分析轨迹不用plumed driver。并且在另一个计算平台上可以运行,所以就是想不明白到底是哪里出现了问题。 |
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