24小时热门版块排行榜    

查看: 1867  |  回复: 6

护发专家

铜虫 (小有名气)

[求助] 请教各位前辈关于Gaussian中的组合方法 已有1人参与

1. 我正在尝试使用组合方法(G4,G3,CBS-4M等等)计算有机分子热力学性质,当我用到G3S这个方法时,报错说我输入有错,请问这是什么原因,其他方法我都是按照这个输入格式输入的,而且G3S方法时Gaussview里直接选择的。如下:
      输入:# g3s geom=connectivity
      输出: QPErr --- A syntax error was detected in the input line.
                   # g3s geom=connectivity
                         '
                   Last state="GCL"
                   TCursr= 1046 LCursr=    2
2. 请问各位前辈,对于组合方法(G1~G4,G3MP2B3,CBS-4M,CBS-QB3,W1U等等)有没有指导性的说明书或者使用介绍,我仅仅在一两个硕博论文里面看到一点点介绍,而且仅限他们自己选择的方法。而且除了遇到问题1以外,对于不同的有机分子,这些组合方法算出来的热力学值与实验值偏差大小都不一样,还没有找到一种既误差可控又试用于大多数有机分子的方法。
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

paramecium86

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
zhou2009: 金币+8 2020-06-28 13:43:44
护发专家: 金币+10, ★★★★★最佳答案, 非常感谢 2020-06-28 15:05:44
可以去看高斯的说明书。支持的的热力学组合方法也就是那么几种。
g1-g4  , 还有g3的几种变体 g3mp2, g3mp2b3
cbs-4m cbs-qb3 cbs-apno
w1u w1bd w1ro

具体想看每种方法的定义就去看看每种方法的原文献就行。

精度来说大体上 w1>g4和cbs-apno>G4MP2>cbs-qb3  >G3MP2B3

g1-g3 过时了  cbs-4m 相对很快但是精度不太行。

热力学方法支持的元素最多前三行。像cbs-apno 就前两行元素。而一般也没法算超过30个原子大小的体系。
一般来说能算所以也不存在普适的方法。依据你的算力来定。

附图是我以前测过的一个计算时间上的比较。除了热力学组合方法还包括一些常规方法计算的时常和精度的比较。
请教各位前辈关于Gaussian中的组合方法
热力学组合方法对比1.png
2楼2020-06-28 11:11:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

paramecium86

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

也有一些文献做过一些评测。基本上精度和时间顺序也差不多就是这个样子。比如这篇

G3S 这关键词高斯16和09里都没有

» 本帖附件资源列表

  • 欢迎监督和反馈:小木虫仅提供交流平台,不对该内容负责。
    本内容由用户自主发布,如果其内容涉及到知识产权问题,其责任在于用户本人,如对版权有异议,请联系邮箱:xiaomuchong@tal.com
  • 附件 1 : 热力学组合对比评测文献1.pdf
  • 2020-06-28 13:06:50, 820.65 K
3楼2020-06-28 13:11:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

护发专家

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by paramecium86 at 2020-06-28 11:11:02
可以去看高斯的说明书。支持的的热力学组合方法也就是那么几种。
g1-g4  , 还有g3的几种变体 g3mp2, g3mp2b3
cbs-4m cbs-qb3 cbs-apno
w1u w1bd w1ro

具体想看每种方法的定义就去看看每种方法的原文献就行。
...

非常感谢前辈的回复,初学gaussian,一直在摸索,您这张表和发给我的文献对我启发和大,非常感谢
4楼2020-06-28 15:07:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

护发专家

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by paramecium86 at 2020-06-28 13:11:37
也有一些文献做过一些评测。基本上精度和时间顺序也差不多就是这个样子。比如这篇

G3S 这关键词高斯16和09里都没有

您好,我还想请教一个问题,我在NIST下载的晶体结构文件,用组合方法计算能能量之后,结构发生了改变,这应该怎么处理,非常感谢
5楼2020-06-28 16:58:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

paramecium86

版主 (著名写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 护发专家 at 2020-06-28 03:58:29
您好,我还想请教一个问题,我在NIST下载的晶体结构文件,用组合方法计算能能量之后,结构发生了改变,这应该怎么处理,非常感谢...

那肯定会改变。热力学组合方法就是算的真空中的孤立分子的热力学量。分子在晶体中的结构跟真空中必然不同。可以用 NoOpt 跳过方法中第一步的优化。但是得到得能量的准确度就未必可以保证了。
6楼2020-06-28 17:06:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

护发专家

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by paramecium86 at 2020-06-28 17:06:23
那肯定会改变。热力学组合方法就是算的真空中的孤立分子的热力学量。分子在晶体中的结构跟真空中必然不同。可以用 NoOpt 跳过方法中第一步的优化。但是得到得能量的准确度就未必可以保证了。...

原来如此,非常感谢,那我还是用真空中的结构吧
7楼2020-06-28 17:28:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 护发专家 的主题更新
信息提示
请填处理意见