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荧光定量PCR数据分析(对照组相对表达量设置问题)
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【悬赏金币】回答本帖问题,作者pylau1988将赠送您 50 个金币
pylau1988
新虫
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在线: 278小时
虫号: 1362142
注册: 2011-08-06
专业: 遗传学与生物信息学
[
求助
]
荧光定量PCR数据分析(对照组相对表达量设置问题)
已有2人参与
大家好,关于荧光定量PCR数据统计分析中,假设用2-ΔΔCT法算出 control组3个生物学重复的相对表达量分别为1.02, 0.98, 1.11,均值为1.04。我看有文献直接将control组均值设为1,数据表示为1±SD,那么这个SD怎么算呢 ,是1.02, 0.98, 1.11这三个值算出的标准差吗?谢谢
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1楼
2020-06-17 13:24:36
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Se7en、
新虫
(初入文坛)
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在线: 4.1小时
虫号: 7123469
注册: 2017-08-31
专业: 微生物学
您好,我最近也遇到这个问题,请问你解决了吗?
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2楼
2020-10-28 17:19:25
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用户晓晓
木虫
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红花: 12
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虫号: 1474220
注册: 2011-11-03
性别: GG
专业: 细胞增殖、生长与分化
【答案】应助回帖
1,采用2--ΔΔCT算法 ΔΔCT计算时如果减去对照组平均值,那么最终计算结果中对照组三个数值的平均值理论值应该是1,但是实际值不可能是1,。当对照组数据无限多时,越接近理论值1.
2,所以直接把对照组当做1是不合理的,绝大多数的文章都是直接使用对照组三个数值来计算平均值标准差,并表示在柱形图中。(当你的对照组数据越理想,平均值越接近于1)
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3楼
2020-10-28 22:05:09
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sunny0810
铁虫
(初入文坛)
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(幼儿园)
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帖子: 9
在线: 3.4小时
虫号: 23271898
注册: 2020-07-27
性别:
MM
专业: 农业昆虫学
【答案】应助回帖
Excel中有公式,好像是STDEVP,具体从百度上一查就知道了,这个很容易算,算一次后面直接代数就可以了
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4楼
2020-11-03 22:05:03
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