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新虫 (初入文坛)

[求助] 第一次做乳酸菌筛选 已有1人参与

我从样品里筛了五十几株菌划了平板,由于时间有点赶,我可以跳过生理生化鉴定,直接做分子鉴定吗?这样工作量怎么样?

@天使托 发自小木虫Android客户端
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biosci

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分子鉴定很快啊,几天就好了

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2楼2020-06-15 08:31:07
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dreamzhang

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

有些细菌并不只有1个16s序列,会包含有1-15拷贝的16s序列,所以单一的16s序列鉴定可能会出现偏差。利用高通量如454或miseq测序一般由于读长的缘故,通常只有300-500多个碱基被测序,所以在物种鉴定上一般比较可靠的是能分类到属,部分能分类到种。因此,个人觉得如果要鉴定准确还是要结合生理生化。
3楼2020-06-18 12:58:04
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hancaas

新虫 (小有名气)

我也是很赶。。。。。
4楼2020-06-19 22:10:55
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