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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【讨论】关于用MS构建晶体遇到的问题
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芝麻582

金虫 (小有名气)

[交流] 【讨论】关于用MS构建晶体遇到的问题

现如今我通过文献数据值构建了一个晶胞，晶胞中包含有两种元素，显示A为9配位，B为12配位。疑惑：构建出来的晶胞的配位数是与我的设置（比如键长的设置）有关吗？还是说这就是真实的晶体的配位数？

[ Last edited by aylayl08 on 2009-11-13 at 20:48 ]
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1楼 2009-07-12 16:09:07
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identation

金虫 (著名写手)
★ ★
aylayl08(金币+2,VIP+0):谢谢专家解答：） 11-15 19:33
一般情况下，根据文献的空间群，晶胞常数和原子坐标，MS中构建的晶体结构配位数会与实际情况一致！件长应该是根据你构建晶体的原子坐标和晶胞常数计算出来的，当你几何优化以后，键长一般会改变！
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2楼2009-11-15 19:27:59
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漂泊四方

金虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
你的键长设置影响的只是成键的显示问题，跟结构和配位数没有关系。不过MS里面经常会遇到键长显示有问题，比如测量两个原子距离，觉得他们应该成键，但是默认显示却没有成键。这个时候可以通过改变键长设置，使得键长显示正常。
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我与我纠缠久
3楼2009-11-16 09:42:49
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carlaty

金虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by identation at 2009-11-15 19:27:
一般情况下，根据文献的空间群，晶胞常数和原子坐标，MS中构建的晶体结构配位数会与实际情况一致！件长应该是根据你构建晶体的原子坐标和晶胞常数计算出来的，当你几何优化以后，键长一般会改变！

才发现自己看错了，“会改变”看成“不会改变”了

[ Last edited by carlaty on 2009-11-16 at 10:10 ]
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4楼2009-11-16 09:48:15
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漂泊四方

金虫 (小有名气)
★
qasd(金币+1,VIP+0):xiexie 11-16 21:36
引用回帖:
Originally posted by carlaty at 2009-11-16 09:48:

我怎么优化后键长多少都会有变化，不过一般在都小于2%的变化幅度

这个跟你选择的泛函，基组都有一定的关系。2%以内应该是正常的结果。
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我与我纠缠久
5楼2009-11-16 09:58:51
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