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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » 晶体解析 » 大家讨论一下使用platon来做空间群测试的时机好吗?
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staphlee

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by xi2004 at 2009-7-12 09:52:



解不出来时, 可再回头在xprep中降.
也可以在.ins中, 直接该latt 类型, +的改成-的, 就使得有心对称的降成非心对称了.

1.在xprep里面怎么降??(我知道有点蠢问题..但真的不太懂)
2.在.ins里面改latt类型
  把+的成-的...那-的呢???要改为+的吗??晕..搞不太懂空间群...
   还要再翻翻书....
3.降完有需要跑一次xs然后xp,xl就这样的程序跑...对吧??
   然后找出所有的非氢原子...在升空间群??对吧??还是最后再升??

天阿...高手一定觉得这些问题有点傻...哀...可是就真的不太懂...只好厚脸皮问问了
帮我回答吧...感恩阿
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11楼2009-07-12 09:59:02
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)
★ ★ ★
staphlee(金币+3,VIP+0): 7-12 10:10
引用回帖:
Originally posted by staphlee at 2009-7-12 09:59:



1.在xprep里面怎么降??(我知道有点蠢问题..但真的不太懂)

可以手工输入....
经常有多选项, 选非心的那个...
还有.....
2.在.ins里面改latt类型
  把+的成-的...那-的呢???要改为+的吗??晕..搞不太懂空间群...
   还要再翻翻书....

+ .....> -
no
- ....> +

3.降完有需要跑一次xs然后xp, ...

当然.


[ Last edited by xi2004 on 2009-7-12 at 10:22 ]
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xi2004-emuch@163.com
12楼2009-07-12 10:08:48
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staphlee

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by xi2004 at 2009-7-12 10:08:


当然.

老师别哭...哀...我翻翻书就不会问这些蠢问题了
但在那之前...可以告诉我如何在xprep里面降吗??
一开始输入cell....然后选项有P,A,B,C,I,F,O,R(选哪个??)
之后找[H] search for higher metric symmetry..
然后有预设选项(只有一个?)
之后选Determine Space group
有triclinic, monoclinic, orthorombic, tetragonal, trigonal/hexagonal, cubic(选哪个??)
之后又有选项有P,A,B,C,I,F,O,R(选哪个??)之后还有.....
要怎样选才是降空间群呢??

哀...我没学过这些阿...没上过这些课...都只能自己摸索阿....指导一下吧
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13楼2009-07-12 10:19:50
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staphlee

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by staphlee at 2009-7-12 10:19:


老师别哭...哀...我翻翻书就不会问这些蠢问题了
但在那之前...可以告诉我如何在xprep里面降吗??
一开始输入cell....然后选项有P,A,B,C,I,F,O,R(选哪个??)
之后找[H] search for higher metric symmetry. ...

有人知道嗎???在xprep中怎樣降空間群...要怎樣選阿??
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14楼2009-07-12 14:09:27
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244073931

至尊木虫 (著名写手)
★
staphlee(金币+1,VIP+0): 7-12 15:55
一般都是先解除框架结构再通过platon检查空间群，Platon建议的空间群不一定正确，特别是手性化合物
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15楼2009-07-12 15:52:28
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staphlee

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by 244073931 at 2009-7-12 15:52:
一般都是先解除框架结构再通过platon检查空间群，Platon建议的空间群不一定正确，特别是手性化合物

你说得先解除框架是什么意思????可以进一步说明吗??
还有阿...你知道我上面13楼的问题吗??(在xprep中降空间群的步骤和选项)
帮我回答一下阿...拜托
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16楼2009-07-12 15:55:20
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腾龙云飞

金虫 (著名写手)
★ ★ ★
staphlee(金币+3,VIP+0): 7-12 16:06
在xprep中可以选择空间群，前几天的帖子上说明了空间群的高低顺序，lz可以看看，如果用默认的解不出就要多xprep几次，直到选到合适的空间群；或者用xi2004老师的方法在.res中把+改为-，然后存为.ins，精修。
解出框架的意思是，除了氢和溶剂外，其他原子基本都命名正确，这是就可以升空间群了，建议不要氢和溶剂都加完之后再升空间群
建议还是多看点书吧，能把xi2004急哭了！！！！！！！！！！！！！！！！
呵呵
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但行好事 莫问前程 _______ 渤海之滨 黄河之津 书生侠骨 义薄惊云
17楼2009-07-12 16:04:30
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staphlee

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by 腾龙云飞 at 2009-7-12 16:04:
在xprep中可以选择空间群，前几天的帖子上说明了空间群的高低顺序，lz可以看看，如果用默认的解不出就要多xprep几次，直到选到合适的空间群；或者用xi2004老师的方法在.res中把+改为-，然后存为.ins，精修。
解出 ...

""如果用默认的解不出就要多xprep几次，直到选到合适的空间群"" (這句話啥意思?)
我还是不太懂耶??多xprep几次??还有到底在xprep里面降空间群...具体要怎样做阿...我13楼的选项分别要选哪些阿???晕. ...

ps.我都没修过这些晶体学的课阿...空间群也没...最近才自学...才会有很多问题的...谢谢大家帮忙啰
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18楼2009-07-12 16:09:29
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腾龙云飞

金虫 (著名写手)
★ ★
staphlee(金币+2,VIP+0): 7-12 16:20
在xprep时不要一直打回车，要看看每句话的意思，空间群可以选择自动生成或手工输入。当选自动生成时，会有所有的空间群选择，一般会默认一个，当默认的解不出结构时，就要选择一个低一点的。这是一种方法，不知道lz能看明白否？？？？？？？？？
在res文件中有： LATT 1
1只是例子，可以为其他数值，降低的办法是把1改为-1
存为.ins
精修
降低完成
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但行好事 莫问前程 _______ 渤海之滨 黄河之津 书生侠骨 义薄惊云
19楼2009-07-12 16:17:01
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staphlee

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by 腾龙云飞 at 2009-7-12 16:17:
在xprep时不要一直打回车，要看看每句话的意思，空间群可以选择自动生成或手工输入。当选自动生成时，会有所有的空间群选择，一般会默认一个，当默认的解不出结构时，就要选择一个低一点的。这是一种方法，不知道 ...

腾龙云飞大哥谢谢你阿...
但是你有看到我13楼的问题吗??就是以下:
我知道空间群是triclinic, monoclinic, orthorombic, tetragonal, trigonal/hexagonal, cubic....
那在这之前和之后都各有一个P,A,B,C,I,F,O,R选项(如最下面)
我之前都选预设值....
这些是什么意思呢??要选哪个来降低空间群???
希望你也别昏倒...我最近才刚始要看有关空间群的东西...帮我答一下巴

"""一开始输入cell....然后选项有P,A,B,C,I,F,O,R(选哪个??)
之后找[H] search for higher metric symmetry..
然后有预设选项(只有一个?)
之后选Determine Space group
有triclinic, monoclinic, orthorombic, tetragonal, trigonal/hexagonal, cubic(选哪个??)
之后又有选项有P,A,B,C,I,F,O,R(选哪个??)之后还有.....
要怎样选才是降空间群呢??""""
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20楼2009-07-12 16:23:57
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