24小时热门版块排行榜    

查看: 1825  |  回复: 7
当前主题已经存档。

CKX

木虫 (著名写手)

[交流] 【求助】如何对不同原子采用不同基组,方法设置,请举例

如何对不同原子采用不同基组,方法设置,请举例

万分感谢
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

loovfnd

至尊木虫 (著名写手)

★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
lei0736(金币+4,VIP+0):谢谢 7-11 10:12
%mem=512MB
# opt b3lyp/gen scf=(qc,maxcyc=300) pseudo=read

Title Card Required

0  1
C 0    3.075980    2.659389    0.081107
C 0    1.836489    1.980934    0.334459
C 0    2.009135    1.147465    1.493489
C 0    3.361861    1.300232    1.944021
C 0    4.023580    2.234658    1.074462
C 0    3.260949   -0.194256   -2.019217
C 0    2.924525   -1.228706   -1.068749
C 0    4.068494   -1.419260   -0.201818
C 0    5.096839   -0.527855   -0.636212
C 0    4.598733    0.224624   -1.758499
Fe 0    3.374888    0.576141   -0.055492
C 0    1.622719   -1.883883   -1.035844
O 0    0.715288   -1.520619   -1.828421
H 0    3.271161    3.345443   -0.728344
H 0    0.932237    2.074753   -0.245524
H 0    1.244445    0.543349    1.960201
H 0    3.805840    0.800336    2.790866
H 0    5.052323    2.551644    1.146145
H 0    2.600399    0.169406   -2.789010
H 0    4.140945   -2.111952    0.621276
H 0    6.071682   -0.420735   -0.186918
H 0    5.139862    0.990510   -2.291448
H 0    1.438760   -2.673666   -0.337774

C  H  N  O  0
3-21g*
****
Fe 0
LANL2DZ
****

[ Last edited by loovfnd on 2009-7-10 at 22:17 ]
莫强求!
2楼2009-07-10 22:15:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

CKX

木虫 (著名写手)

C  H  N  O  0
3-21g*
****
Fe 0
LANL2DZ
****
请问这里的***是什么意思啊?
3楼2009-07-10 22:23:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

flyskysky

银虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
同问!
为什么我的gjf里
Fe 0
LANL2DZ
****
要出现两次呢?
有做顺磁自由基的朋友吗,大家交流一下吧!flyskysky@126.com
4楼2009-07-11 08:06:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

王中学

木虫 (正式写手)

海边拾贝的顽童

★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
lei0736(金币+4,VIP+0):谢谢 7-11 10:12
%mem=512MB
# opt b3lyp/gen scf=(qc,maxcyc=300) pseudo=read

Title Card Required

0  1
C 0    3.075980    2.659389    0.081107
C 0    1.836489    1.980934    0.334459
C 0    2.009135    1.147465    1.493489
C 0    3.361861    1.300232    1.944021
C 0    4.023580    2.234658    1.074462
C 0    3.260949   -0.194256   -2.019217
C 0    2.924525   -1.228706   -1.068749
C 0    4.068494   -1.419260   -0.201818
C 0    5.096839   -0.527855   -0.636212
C 0    4.598733    0.224624   -1.758499
Fe 0    3.374888    0.576141   -0.055492
C 0    1.622719   -1.883883   -1.035844
O 0    0.715288   -1.520619   -1.828421
H 0    3.271161    3.345443   -0.728344
H 0    0.932237    2.074753   -0.245524
H 0    1.244445    0.543349    1.960201
H 0    3.805840    0.800336    2.790866
H 0    5.052323    2.551644    1.146145
H 0    2.600399    0.169406   -2.789010
H 0    4.140945   -2.111952    0.621276
H 0    6.071682   -0.420735   -0.186918
H 0    5.139862    0.990510   -2.291448
H 0    1.438760   -2.673666   -0.337774

C  H  N  O  0
3-21g*
****
Fe 0
LANL2DZ
****
(一空行)
Fe 0
LANL2DZ
(两空行以上)

我认为这样才是真确的格式
君当如兰,幽谷长风,宁静志远
5楼2009-07-11 09:40:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

王中学

木虫 (正式写手)

海边拾贝的顽童

★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 7-11 10:12
这是采用混合基组进行运算,对C/H/N/O采用B3LYP/3-21G*,对铁采用赝势机组LANL2DZ,借用了loovfnd 大哥的例子,请不要介意啊,只是想说清问题
君当如兰,幽谷长风,宁静志远
6楼2009-07-11 09:43:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hairan

木虫 (著名写手)

瞌睡木虫

★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
lei0736(金币+4,VIP+0):谢谢 7-11 19:43
引用回帖:
Originally posted by CKX at 2009-7-10 22:23:
C  H  N  O  0
3-21g*
****
Fe 0
LANL2DZ
****
请问这里的***是什么意思啊?

同问!
为什么我的gjf里
Fe 0
LANL2DZ
****
要出现两次呢?  

四个"*"是Gaussian关于定义基祖的标识,也就是告诉程序四个“*”上面的字符代表基组

后面一个虫子问的“为什么要出现两次LANL2DZ”就涉及到不带四个"*"的问题
不带四个"*"的时候就是告诉程序这里输入的是对应了这个基组名字的赝势。

如果使用了gen关键词,又用到了赝势基组那么就必须读入赝势,否则计算会出错,就算勉强计算完了,你会发现结果也是异常的,比方说围绕金属周围的键的键长都出奇的短。
据权威报纸调查,84%的青少年犯罪者有玩电子游戏的经历,故应该禁止经营电子游戏。据我们所知,100%的青少年犯罪者有穿鞋的经历,故制鞋厂应该停业。
7楼2009-07-11 19:30:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

szmeng

至尊木虫 (文坛精英)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 7-12 11:24
过渡元素,电子层数多的元素可用SDD,LanL2DZ赝势基组运算。
8楼2009-07-12 10:08:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 CKX 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
信息提示
请填处理意见