24小时热门版块排行榜    

查看: 659  |  回复: 3
当前主题已经存档。

wdy0330

铜虫 (初入文坛)

[交流] 半定量试验中内参18S问题

麻烦问下在RNA反转录中使用random与oligo引物各有什么优缺点?


本人在做半定量PCR时是选用18S作为内参,那为了获得18S的cDNA,在反转录时应该是使用random引物吧?


但在反转录时我同样使用了oligo引物,后采用18S特异引物扩增,竟然扩增出了我所要的片段,只是扩增出来的条带亮度比我的目的基因特异扩增条带亮度小,这该如何解释??多谢!

曾经以为是RNA中有DNA污染,但后来试验证明应该不是,不知如何是好?

我RNA样品原来是用Oligo-dT引物反转录的,3组样品均得到了自己的目的基因,其中B,C样品有18S条带,A样品无。

今天又使用同样的A,B,C样品RNA,使用随机引物反转录,同样均得到了自己的目的基因,但是18S条带出现情况却不和上面的一致,A,C样品有18S条带,B样品却没有无。

通过A,B样品的两种引物反转录情况,这应该可以得出不是由于DNA污染所致吧,不然两次反转录应该都产生条带才对。

实在纳闷!!!!望高人指点!
回复此楼

» 猜你喜欢

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
18s的引物没设计好吧……用beta-actin一类的吧~~
2楼2009-07-10 11:28:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wdy0330

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
Originally posted by 三磷酸腺苷 at 2009-7-10 11:28:
18s的引物没设计好吧……用beta-actin一类的吧~~

我所做的我这个基因的物种中只有18S序列是已知的,其他全部未知!

此外既然三中样品都有用我的18S引物P出来并且大小合适,那就证明这对引物问题不大吧!
3楼2009-07-11 14:59:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)

大小合适也不一定就是目的基因,若要证明可以克隆了测序
有个师兄曾经遇到过这种情况,因为他们要扩的东西非常多,有两三次就是大小正确但不是目的片段
4楼2009-07-11 15:17:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 wdy0330 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 286求调剂 +3 lemonzzn 2026-03-16 5/250 2026-03-16 20:43 by lemonzzn
[考研] 326求调剂 +4 上岸的小葡 2026-03-15 5/250 2026-03-16 08:39 by Linda Hu
[考研] 机械专硕调剂 +3 笨笨兔子 2026-03-12 3/150 2026-03-15 20:02 by 栗子粥?
[考博] 欢迎申博同学联系 +3 天道酬勤2026686 2026-03-10 7/350 2026-03-15 19:03 by 天道酬勤2026686
[考研] 274求调剂 +4 时间点 2026-03-13 4/200 2026-03-15 15:29 by Rambo13
[考研] 294求调剂 +3 Zys010410@ 2026-03-13 4/200 2026-03-15 10:59 by zhq0425
[考研] 本科南京大学一志愿川大药学327 +3 麦田耕者 2026-03-14 3/150 2026-03-14 20:04 by 外星文明
[考研] 289求调剂 +4 这么名字咋样 2026-03-14 6/300 2026-03-14 18:58 by userper
[考研] 297一志愿上交085600求调剂 +5 指尖八千里 2026-03-14 5/250 2026-03-14 17:26 by a不易
[考研] 云南财经大学信息学院计算机学硕专硕学位点 +3 zjptai 2026-03-10 5/250 2026-03-14 01:23 by 飞行琦
[考研] 321求调剂 +3 CUcat 2026-03-10 3/150 2026-03-14 00:25 by JourneyLucky
[考研] 0703,333分求调剂 一志愿郑州大学-物理化学 +3 李魔女斗篷 2026-03-11 3/150 2026-03-13 22:24 by JourneyLucky
[考研] 求材料调剂 085600英一数二总分302 前三科235 精通机器学习 一志愿哈工大 +4 林yaxin 2026-03-12 4/200 2026-03-13 22:04 by 星空星月
[考研] 310求调剂 +3 【上上签】 2026-03-11 3/150 2026-03-13 16:16 by JourneyLucky
[考研] 328化工专硕求调剂 +4 。,。,。,。i 2026-03-12 4/200 2026-03-13 14:44 by JourneyLucky
[考研] 材料301分求调剂 +5 Liyouyumairs 2026-03-12 5/250 2026-03-13 14:42 by JourneyLucky
[考博] 26读博 +4 Rui135246 2026-03-12 10/500 2026-03-13 07:15 by gaobiao
[考研] 085600 材料与化工 295 求调剂 +10 dream…… 2026-03-10 12/600 2026-03-12 13:46 by dream……
[考博] 读博申请 +5 感dd 2026-03-10 7/350 2026-03-11 17:02 by QGZDSYS
[考研] 0703化学调剂 +3 三dd. 2026-03-10 3/150 2026-03-10 15:45 by peike
信息提示
请填处理意见