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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 资源 » 请问谁会molecular modeling，同时求助相关软件
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l1245

新虫 (小有名气)

[求助] 请问谁会molecular modeling，同时求助相关软件 已有2人参与

求助分子对接计算

@smutao 发自小木虫IOS客户端
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1楼 2020-05-21 17:36:30
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痴槑

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

Chem3D用来使配体小分子能量最小化
AutoDock4.2用来分子对接
PyMol用来除去受体蛋白水分子、原配体以及分子对接结果可视化
PDB在线网站用来检索蛋白质分子的3D结构
Pubchem在线网站用来检索配体小分子结构
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2楼2020-05-28 10:28:37
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依蓝若雪

铁杆木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 痴槑 at 2020-05-28 10:28:37
Chem3D用来使配体小分子能量最小化
AutoDock4.2用来分子对接
PyMol用来除去受体蛋白水分子、原配体以及分子对接结果可视化
PDB在线网站用来检索蛋白质分子的3D结构
Pubchem在线网站用来检索配体小分子结构

想问一下，你这边有分子对接的相关视频或者学习的文件吗？最近想学做分子对接。感谢感谢！
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3楼2020-06-11 19:41:34
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cngdkpmg

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

楼主，用于做分子对接的软件有很多，例如DS、Autodock 4、Autodock vina、UCSF DOCK 6.9。我自己也用过这些软件，比较麻烦，总是老打命令。我现在都是花一点小钱，用殷赋科技公司的云平台，计算又快又准确。
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4楼2020-06-18 10:48:19
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