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dontgogent

新虫 (小有名气)

[交流] Vasp做桥位吸附计算如何固定原子? 已有1人参与

在用vasp做桥位吸附计算的时候发现结构优化后会跑到附近的fcc位,所以就固定了吸附原子的x,y方向只放开了z方向,不知道这样做对不对?是否可靠?如果不对应该如何处理……

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dontgogent

新虫 (小有名气)

2楼2020-04-14 12:10:10
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卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
优化完还这样说明bridge site并不是个稳定结构,当然还有大前提就是计算方法和参数都是可靠的。

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不一定挂在论坛,计算问题问题欢迎留言。
3楼2020-04-14 12:36:33
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dontgogent

新虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by 卡开发发 at 2020-04-14 12:36:33
优化完还这样说明bridge site并不是个稳定结构,当然还有大前提就是计算方法和参数都是可靠的。

谢谢您~
再请教一下,计算了fcc位确实是能量更低的位置~
我想了想,如果我想得到桥位的吸附,会不会有可能是模型的对称性原因导致优化的过程原子向fcc移动了,如果建模把原子很准确的在桥位上,保持好的对称性,是否放开xyz三个方向之后,原子属于就处于特殊位置上,优化过程中就会只朝着z方向优化……
准备去试试~

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4楼2020-04-14 17:22:17
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dontgogent

新虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by 卡开发发 at 2020-04-14 12:36:33
优化完还这样说明bridge site并不是个稳定结构,当然还有大前提就是计算方法和参数都是可靠的。

谢谢您~
是准备在bridge 和 fcc hcp分别吸附一下看看

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5楼2020-04-14 17:24:13
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dontgogent

新虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by 卡开发发 at 2020-04-14 12:36:33
优化完还这样说明bridge site并不是个稳定结构,当然还有大前提就是计算方法和参数都是可靠的。

谢谢您~
是准备在bridge 和 fcc hcp分别吸附一下看看

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6楼2020-04-14 17:24:13
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卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
4楼: Originally posted by dontgogent at 2020-04-14 17:22:17
谢谢您~
再请教一下,计算了fcc位确实是能量更低的位置~
我想了想,如果我想得到桥位的吸附,会不会有可能是模型的对称性原因导致优化的过程原子向fcc移动了,如果建模把原子很准确的在桥位上,保持好的对称性, ...

约束xy的情况在z方向找到的极小不一定是势能面的极小点,也可能是个鞍点,甚至可能鞍点都不是。

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不一定挂在论坛,计算问题问题欢迎留言。
7楼2020-04-14 18:49:44
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dontgogent

新虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
7楼: Originally posted by 卡开发发 at 2020-04-14 18:49:44
约束xy的情况在z方向找到的极小不一定是势能面的极小点,也可能是个鞍点,甚至可能鞍点都不是。...

谢谢~

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8楼2020-04-14 20:24:50
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