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高斯找过渡态 已有3人参与
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在找过渡态时,调了两个结构,都找到过渡态。这两个能量还会不一样?那是不是还会存在能量更低的过渡态,怎么解决? 发自小木虫Android客户端 |
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2楼2020-04-12 22:31:43

3楼2020-04-12 22:32:51
www1
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4楼2020-04-13 07:36:45
5楼2020-04-13 08:11:43
paramecium86
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不知道你调整的TS结构 是怎么调整的,是那种变化很大的调整,还就是把若干C-C单键旋转一下那种调整。 找到多于一个过渡态的话,最好先跑一下IRC验证一下,是否这些过渡态都是连接你的反应物产物的过渡态。毕竟反应路径上,就某一步反应来说,也就是同一条势能曲线上的两个势能曲线低点之间应该有且只有一个过渡态。不同的过渡态代表了不同的反应路径。而不同的反应路径一般代表了会有很不一样的结构,和虚频的振动模式。 一般的基元反应很少见能有非常多条反应路径连接在同样的的反应物和产物之间。 而就计算来说如果是用 opt=ts 得到的有一个虚频的结构 ,那未必是连接你需要的,反应物和产物之间的那个过渡态。这时候需要IRC验证一下。IRC跑完 两端结构跟你的反应物产物结构相符才可以。 很可能调整了TS结构 跑出来IRC两端的 反应物产物结构也发生了变化。 |
6楼2020-04-13 09:52:12
7楼2020-04-13 11:08:15
paramecium86
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8楼2020-04-13 11:37:51
9楼2020-04-13 13:44:20













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