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airpaul金虫 (小有名气)
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质谱数据中未注释的蛋白如何确定功能和分析？
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 各位虫友大神，我在分析一些蛋白质功能的时候遇到一些问题。现有一种链霉菌的质谱数据，但目前这个菌的基因组还没有被注释，质谱结果只给出了蛋白序列的Accession号，若想尽量多了解这个菌中的蛋白有哪些功能有哪些办法？目前的想法是通过比对来注释，但是比对结果的衡量标准好像没有比较明确的规定，不太好把握。或者，从亲缘关系比较近的菌，注释信息多一点的入手，例如天蓝色链霉菌（模式菌？）比对它的蛋白序列，得到所研究菌的蛋白信息，如何将研究菌质谱结果中的蛋白序列同天蓝色链霉菌的蛋白序列进行批量比对？望有经验的虫友不吝赐教 |
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airpaul
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